More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1574 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  100 
 
 
587 aa  1215    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  67.7 
 
 
611 aa  317  4e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  60.83 
 
 
267 aa  295  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  55.04 
 
 
336 aa  265  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  32.81 
 
 
636 aa  252  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  52.84 
 
 
263 aa  223  6e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  49.21 
 
 
475 aa  219  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  48.28 
 
 
820 aa  218  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  48.71 
 
 
358 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  51.29 
 
 
623 aa  214  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  48.26 
 
 
618 aa  209  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  47.64 
 
 
802 aa  209  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
882 aa  208  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  49.57 
 
 
603 aa  207  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  29.43 
 
 
654 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  49.57 
 
 
620 aa  203  7e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  48.05 
 
 
617 aa  202  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  46.98 
 
 
781 aa  201  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  51.42 
 
 
287 aa  201  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  39.16 
 
 
637 aa  200  7e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  40.45 
 
 
625 aa  199  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  46.35 
 
 
593 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  42.01 
 
 
616 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  47.44 
 
 
621 aa  196  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  46.32 
 
 
929 aa  193  8e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  43.8 
 
 
637 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  40.56 
 
 
538 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  46.18 
 
 
925 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  46.03 
 
 
446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  41.91 
 
 
351 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  44.02 
 
 
416 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1263  protein of unknown function DUF323  43.62 
 
 
254 aa  184  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.211792  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  43.27 
 
 
740 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  47.1 
 
 
892 aa  184  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  43.8 
 
 
620 aa  182  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  40.56 
 
 
639 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  40.56 
 
 
639 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  45.16 
 
 
877 aa  182  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  41.24 
 
 
1196 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  42.8 
 
 
269 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  44.02 
 
 
1911 aa  175  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  44.35 
 
 
522 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  39.18 
 
 
346 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  47.32 
 
 
276 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  37.92 
 
 
584 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  38.06 
 
 
453 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  41.03 
 
 
293 aa  167  5e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  38.7 
 
 
287 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  42.79 
 
 
279 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  45.61 
 
 
282 aa  164  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  43.36 
 
 
527 aa  163  8.000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  42.15 
 
 
305 aa  163  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  40.32 
 
 
1132 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  43.92 
 
 
862 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  38.37 
 
 
1104 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  42.52 
 
 
281 aa  160  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  40.98 
 
 
768 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1675  hypothetical protein  39.5 
 
 
488 aa  159  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  38.19 
 
 
426 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  43.72 
 
 
298 aa  157  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  36.6 
 
 
359 aa  156  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  40.34 
 
 
654 aa  156  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  43.14 
 
 
664 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  35.14 
 
 
715 aa  156  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  40.29 
 
 
336 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  39.59 
 
 
952 aa  153  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  39.06 
 
 
657 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  40.53 
 
 
327 aa  151  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  39.91 
 
 
616 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  40.35 
 
 
922 aa  150  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  39.11 
 
 
334 aa  150  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  37.35 
 
 
301 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  39.5 
 
 
289 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1251  serine/threonine protein kinase  32.7 
 
 
555 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128059  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  37.86 
 
 
323 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  34.38 
 
 
292 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2020  protein of unknown function DUF323  34.38 
 
 
292 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  36.44 
 
 
284 aa  146  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  36.44 
 
 
535 aa  146  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  35.66 
 
 
570 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  35.19 
 
 
509 aa  145  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  33.85 
 
 
491 aa  143  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.5 
 
 
554 aa  143  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  38.26 
 
 
413 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  37.55 
 
 
262 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  38.56 
 
 
523 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  33.45 
 
 
293 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  35.63 
 
 
283 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  38.21 
 
 
292 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  34.05 
 
 
296 aa  139  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  35.94 
 
 
489 aa  139  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  35.6 
 
 
292 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  36.63 
 
 
245 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  38.6 
 
 
497 aa  139  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  36.69 
 
 
286 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  36.93 
 
 
226 aa  137  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  33.46 
 
 
586 aa  136  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  39.13 
 
 
611 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  36.93 
 
 
226 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  38.72 
 
 
321 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>