More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1004 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
298 aa  614  1e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  41.91 
 
 
293 aa  192  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  42.21 
 
 
263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  44.83 
 
 
475 aa  169  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  43.72 
 
 
587 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  40.83 
 
 
768 aa  155  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  41.6 
 
 
620 aa  155  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  40.08 
 
 
398 aa  155  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  42.26 
 
 
668 aa  152  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  38.66 
 
 
287 aa  149  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  42.36 
 
 
611 aa  149  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  39.83 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  38.4 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  41 
 
 
637 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  39.92 
 
 
621 aa  146  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  40.93 
 
 
625 aa  146  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  41.26 
 
 
276 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  39.52 
 
 
820 aa  142  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  36.89 
 
 
351 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  36.13 
 
 
802 aa  142  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  38.93 
 
 
336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  36.98 
 
 
517 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  38.75 
 
 
287 aa  140  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  37.45 
 
 
1132 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  34.56 
 
 
829 aa  139  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  35.05 
 
 
781 aa  139  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  35.48 
 
 
593 aa  139  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  35.68 
 
 
279 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  35.1 
 
 
346 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  38.17 
 
 
358 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  36.51 
 
 
269 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  33.21 
 
 
586 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  38.27 
 
 
603 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  35.36 
 
 
877 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  36.17 
 
 
359 aa  135  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  37.87 
 
 
282 aa  135  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  34.16 
 
 
416 aa  135  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  39.74 
 
 
446 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  35.94 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  38.2 
 
 
617 aa  133  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  40.53 
 
 
636 aa  132  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  38.46 
 
 
922 aa  132  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  31.85 
 
 
826 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  34.07 
 
 
325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 
715 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  33.08 
 
 
433 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  36.71 
 
 
398 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  35.89 
 
 
616 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  41.94 
 
 
618 aa  129  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  33.33 
 
 
348 aa  129  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1263  protein of unknown function DUF323  36.1 
 
 
254 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.211792  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  35.86 
 
 
882 aa  129  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  37.45 
 
 
925 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  33.9 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.22 
 
 
554 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  38.02 
 
 
623 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  33.93 
 
 
952 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  38.49 
 
 
929 aa  126  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  34.47 
 
 
527 aa  126  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  32.3 
 
 
281 aa  125  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  35.36 
 
 
1104 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  33.45 
 
 
742 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  35.55 
 
 
664 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  31.52 
 
 
336 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  34.34 
 
 
637 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  32.34 
 
 
390 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  31.5 
 
 
751 aa  123  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  33.21 
 
 
489 aa  122  5e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  35.27 
 
 
522 aa  122  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  38.2 
 
 
509 aa  122  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  34.47 
 
 
639 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  34.47 
 
 
639 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1675  hypothetical protein  35.37 
 
 
488 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  36.11 
 
 
740 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  32.6 
 
 
892 aa  118  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  32.72 
 
 
862 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  34.57 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1251  serine/threonine protein kinase  32.96 
 
 
555 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128059  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  32.55 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  31.13 
 
 
1911 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  32.4 
 
 
517 aa  116  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  34.03 
 
 
305 aa  116  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  31.78 
 
 
288 aa  115  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  36.18 
 
 
291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  31.85 
 
 
1196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  36.32 
 
 
413 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  33.21 
 
 
323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  29.07 
 
 
620 aa  113  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  31.89 
 
 
292 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2445  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.21 
 
 
896 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354619  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2020  protein of unknown function DUF323  31.89 
 
 
292 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  31.23 
 
 
277 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  32.33 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  29.22 
 
 
538 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  27.48 
 
 
426 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  30.42 
 
 
321 aa  108  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  32.01 
 
 
523 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  31.84 
 
 
453 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>