More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2479 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
398 aa  834    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  87.94 
 
 
398 aa  733    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  52.69 
 
 
517 aa  431  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  54.08 
 
 
586 aa  331  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  58.08 
 
 
267 aa  308  9e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  52.76 
 
 
826 aa  302  8.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  53.33 
 
 
742 aa  301  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  54.48 
 
 
433 aa  300  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  54.15 
 
 
829 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  49.26 
 
 
319 aa  278  9e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  50.71 
 
 
325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  50.79 
 
 
751 aa  261  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  48.26 
 
 
517 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  42.25 
 
 
1911 aa  195  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  45.49 
 
 
269 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  47.01 
 
 
603 aa  191  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  45.73 
 
 
781 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  46.77 
 
 
877 aa  187  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
617 aa  186  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  45 
 
 
621 aa  185  9e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  45.3 
 
 
882 aa  184  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  41.9 
 
 
1132 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  42.92 
 
 
625 aa  182  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  39.23 
 
 
538 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  45 
 
 
636 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  44.58 
 
 
740 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  43.25 
 
 
527 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  40.08 
 
 
351 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  41.31 
 
 
892 aa  176  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  40.93 
 
 
802 aa  177  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  42.98 
 
 
637 aa  176  8e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  41.8 
 
 
925 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  44.3 
 
 
620 aa  175  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  43.33 
 
 
593 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  42.19 
 
 
929 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  42.44 
 
 
358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  37.97 
 
 
1104 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  41.88 
 
 
618 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  43.03 
 
 
862 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  41.1 
 
 
287 aa  171  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  42.92 
 
 
820 aa  170  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  39.48 
 
 
287 aa  168  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  40.91 
 
 
637 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  41.7 
 
 
664 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  29.84 
 
 
453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  37.82 
 
 
426 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  40.52 
 
 
522 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  36.98 
 
 
489 aa  161  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  40.75 
 
 
1196 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  38.31 
 
 
654 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  41.38 
 
 
305 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  39.92 
 
 
639 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  39.92 
 
 
639 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  39.3 
 
 
281 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  36.73 
 
 
346 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  36.04 
 
 
584 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  39.17 
 
 
623 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  40.65 
 
 
768 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  39.34 
 
 
616 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  49.35 
 
 
566 aa  149  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  38.68 
 
 
416 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  39.83 
 
 
293 aa  147  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  37.5 
 
 
289 aa  142  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  42.29 
 
 
692 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  37.9 
 
 
620 aa  140  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  34.3 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  37.6 
 
 
587 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  35.46 
 
 
279 aa  133  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  47.25 
 
 
1581 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  58.49 
 
 
360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  32.09 
 
 
348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  32.09 
 
 
348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  36.71 
 
 
298 aa  129  8.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.25 
 
 
554 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  33.83 
 
 
292 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  32.62 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  36.44 
 
 
288 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  36.78 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  34.11 
 
 
282 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  36.18 
 
 
291 aa  126  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  33.61 
 
 
277 aa  126  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  34.31 
 
 
715 aa  126  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  30.74 
 
 
390 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  36.03 
 
 
359 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  37.34 
 
 
263 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  38.14 
 
 
668 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  34.45 
 
 
285 aa  122  8e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  33.45 
 
 
509 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2020  protein of unknown function DUF323  33.07 
 
 
292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  33.07 
 
 
292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  36.33 
 
 
475 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  35.42 
 
 
287 aa  119  7.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  36.44 
 
 
611 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  33.72 
 
 
284 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  33.99 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  35.98 
 
 
336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  33.88 
 
 
491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  40.88 
 
 
301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  30.79 
 
 
1186 aa  117  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  34.15 
 
 
276 aa  116  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>