43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0204 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  100 
 
 
360 aa  743    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1563  major paralogous domain  55.29 
 
 
236 aa  241  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.398386  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0863  major paralogous domain protein  54.33 
 
 
245 aa  235  8e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  0.340408 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0481  major paralogous domain protein  57.14 
 
 
221 aa  226  6e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1284  major paralogous domain protein  47.6 
 
 
230 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0926983  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2440  major paralogous domain protein  47.09 
 
 
222 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0434  hypothetical protein  51.55 
 
 
232 aa  192  7e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436298  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2079  hypothetical protein  46.86 
 
 
223 aa  191  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.970801 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1345  hypothetical protein  44.76 
 
 
224 aa  187  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1586  hypothetical protein  49.27 
 
 
250 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.812157  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0884  hypothetical protein  45.37 
 
 
225 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2565  hypothetical protein  44.5 
 
 
238 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182499  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2181  major paralogous domain protein  44.39 
 
 
223 aa  171  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1562  major paralogous domain  42.86 
 
 
197 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.632869  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0523  hypothetical protein  45.96 
 
 
223 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0460  hypothetical protein  45.18 
 
 
217 aa  162  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0870  major paralogous domain protein  41.18 
 
 
219 aa  161  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878684  normal  0.0381164 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1157  hypothetical protein  41.35 
 
 
251 aa  157  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.299926 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2424  hypothetical protein  42.64 
 
 
212 aa  152  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0482  hypothetical protein  42.93 
 
 
207 aa  152  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  58.49 
 
 
398 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  58.49 
 
 
398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  48.78 
 
 
586 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  43.18 
 
 
517 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  53.33 
 
 
566 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  37.5 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1658  hypothetical protein  34.93 
 
 
202 aa  116  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  40.15 
 
 
517 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2976  hypothetical protein  28.63 
 
 
228 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  37.4 
 
 
570 aa  92.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3998  hypothetical protein  45.28 
 
 
478 aa  86.3  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0094  major paralogous domain protein  32.73 
 
 
213 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718944  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  32.41 
 
 
367 aa  50.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.23 
 
 
490 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  29.36 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0481  hypothetical protein  26.32 
 
 
163 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  26.17 
 
 
541 aa  47.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
1526 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  32.65 
 
 
320 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  32.65 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  30.51 
 
 
384 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  28.57 
 
 
1611 aa  43.9  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3348  hypothetical protein  29.89 
 
 
323 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>