49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1939 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 		 566 aa  1170    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  64.63 
 
 		 586 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  50.59 
 
 		 517 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  56 
 
 		 517 aa  174  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  50 
 
 		 398 aa  150  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  49.35 
 
 		 398 aa  149  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1946  hypothetical protein  86.84 
 
 		 306 aa  144  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00997361  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  44.85 
 
 		 286 aa  124  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  53.33 
 
 		 360 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0898  hypothetical protein  76.47 
 
 		 313 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1940  hypothetical protein  79.37 
 
 		 202 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000736005  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0897  hypothetical protein  78.69 
 
 		 202 aa  111  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  35.2 
 
 		 570 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3998  hypothetical protein  28.26 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2751  glycoside hydrolase family protein  32.06 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  31.43 
 
 		 367 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04515  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  30.08 
 
 		 435 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000384453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4600  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 277 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  33.33 
 
 		 598 aa  54.7  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  31.15 
 
 		 334 aa  54.7  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1209  licheninase  30.33 
 
 		 260 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0812437 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2550  endo-beta-1,3-1,4-glycanase protein  30.33 
 
 		 260 aa  54.7  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03053  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  33.33 
 
 		 364 aa  54.3  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.736555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3662  glycoside hydrolase family protein  30.07 
 
 		 593 aa  53.9  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0061  exported glycosyl hydrolase, family 16  26.52 
 
 		 264 aa  53.9  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.558429  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5929  endo-1,3-1,4-beta-glycanase  26.15 
 
 		 268 aa  53.5  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_25832  cell wall protein in family of putative glycosidases Probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase  28.1 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.623887  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02690  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14030)  22.73 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4988  glycoside hydrolase family protein  25.5 
 
 		 372 aa  50.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4955  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 		 269 aa  50.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126867 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03914  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  26.51 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.349103 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  31.03 
 
 		 2135 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.36 
 
 		 490 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413243 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06948  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  24.37 
 
 		 367 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00933  extracellular cell wall glucanase Crf1/allergen Asp F9 (AFU_orthologue; AFUA_1G16190)  29.67 
 
 		 405 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0489883  normal  0.840082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3409  hypothetical protein  28.35 
 
 		 796 aa  48.5  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.835686  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1972  glycoside hydrolase family protein  25.7 
 
 		 260 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0648  glycoside hydrolase family protein  27.54 
 
 		 253 aa  48.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  29.36 
 
 		 303 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  30.68 
 
 		 413 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  29.8 
 
 		 608 aa  47.8  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40512  predicted protein  24.79 
 
 		 346 aa  47  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  27.37 
 
 		 314 aa  47  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06819  conserved hypothetical protein  29.2 
 
 		 296 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0481  hypothetical protein  26.15 
 
 		 163 aa  44.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  29.55 
 
 		 137 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  25 
 
 		 880 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  32.26 
 
 		 825 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  33.72 
 
 		 880 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>