31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1972 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1972  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 260 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2550  endo-beta-1,3-1,4-glycanase protein  75.38 
 
 		 260 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1209  licheninase  75.77 
 
 		 260 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0812437 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4955  glycoside hydrolase family protein  48.06 
 
 		 269 aa  260  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126867 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5929  endo-1,3-1,4-beta-glycanase  46.12 
 
 		 268 aa  244  6.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0648  glycoside hydrolase family protein  52.31 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4600  glycoside hydrolase family protein  38.1 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  30.74 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2751  glycoside hydrolase family protein  26.51 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0061  exported glycosyl hydrolase, family 16  25.11 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.558429  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2802  b-glucosidase  28.99 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.790099  normal  0.396341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2825  glycoside hydrolase family protein  23.35 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4988  glycoside hydrolase family protein  25.73 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3662  glycoside hydrolase family protein  26.8 
 
 		 593 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  28.02 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04515  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  25.39 
 
 		 435 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000384453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  25.7 
 
 		 566 aa  48.9  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1017  glycoside hydrolase family 16  30.46 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06948  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  23.35 
 
 		 367 aa  46.6  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03053  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  27.87 
 
 		 364 aa  46.2  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.736555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  24.53 
 
 		 883 aa  45.8  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3145  glycoside hydrolase family 16  26.44 
 
 		 300 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544499  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  21.67 
 
 		 556 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  25.98 
 
 		 1321 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  28.25 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4761  hypothetical protein  24.83 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.202434  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_25832  cell wall protein in family of putative glycosidases Probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase  23.26 
 
 		 413 aa  43.5  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.623887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  26.97 
 
 		 637 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40512  predicted protein  23.62 
 
 		 346 aa  43.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4636  hypothetical protein  26.88 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  25.69 
 
 		 289 aa  42.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>