More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2809 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 1321 aa  2702    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  40.54 
 
 		 883 aa  516  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.81 
 
 		 1694 aa  339  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  39.86 
 
 		 642 aa  271  5e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  40.28 
 
 		 641 aa  271  8.999999999999999e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  40.17 
 
 		 1081 aa  263  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  41.62 
 
 		 1290 aa  258  7e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.71 
 
 		 627 aa  252  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  50.59 
 
 		 281 aa  233  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  44.81 
 
 		 633 aa  228  5.0000000000000005e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  45.56 
 
 		 279 aa  226  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  42.72 
 
 		 328 aa  221  6e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.81 
 
 		 532 aa  221  6e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  47.04 
 
 		 423 aa  221  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  42.36 
 
 		 694 aa  218  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  48.16 
 
 		 291 aa  214  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  45.83 
 
 		 276 aa  214  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  46.64 
 
 		 289 aa  213  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  40.45 
 
 		 912 aa  213  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  45.77 
 
 		 282 aa  209  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.86 
 
 		 358 aa  209  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  40.91 
 
 		 291 aa  207  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  33.85 
 
 		 1710 aa  207  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  40 
 
 		 884 aa  206  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  44.84 
 
 		 288 aa  202  5e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  42.55 
 
 		 283 aa  197  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  37.97 
 
 		 1918 aa  196  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.07 
 
 		 328 aa  195  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  30.75 
 
 		 1421 aa  192  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  42.69 
 
 		 426 aa  190  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.71 
 
 		 742 aa  186  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.37 
 
 		 306 aa  184  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  41.11 
 
 		 503 aa  181  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  39.04 
 
 		 383 aa  180  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  42.32 
 
 		 301 aa  179  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  41.92 
 
 		 588 aa  177  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  41.5 
 
 		 274 aa  177  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  44.18 
 
 		 286 aa  177  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  34.75 
 
 		 758 aa  176  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.11 
 
 		 315 aa  175  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.84 
 
 		 252 aa  172  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  33.13 
 
 		 409 aa  171  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  39.13 
 
 		 389 aa  171  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  38.55 
 
 		 1028 aa  165  5.0000000000000005e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  40.64 
 
 		 286 aa  164  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  42.13 
 
 		 1226 aa  163  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  40.46 
 
 		 1332 aa  162  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  41.18 
 
 		 556 aa  161  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  37.64 
 
 		 330 aa  159  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  39.16 
 
 		 384 aa  157  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  36.91 
 
 		 920 aa  155  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  40.35 
 
 		 926 aa  152  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  37.5 
 
 		 288 aa  151  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  36.03 
 
 		 469 aa  149  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  38.5 
 
 		 427 aa  148  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  37.05 
 
 		 569 aa  147  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  36.16 
 
 		 752 aa  145  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.83 
 
 		 819 aa  140  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0275  S-layer domain protein  29.07 
 
 		 830 aa  139  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  36.5 
 
 		 313 aa  138  6.0000000000000005e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  41.01 
 
 		 320 aa  137  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  37.88 
 
 		 531 aa  134  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  32.33 
 
 		 2117 aa  133  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.85 
 
 		 290 aa  134  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  28.25 
 
 		 1059 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  33.8 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  39.88 
 
 		 1194 aa  131  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  33.9 
 
 		 405 aa  130  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.11 
 
 		 547 aa  129  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  37.71 
 
 		 1009 aa  129  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  34.93 
 
 		 1441 aa  128  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.88 
 
 		 261 aa  128  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  34 
 
 		 238 aa  128  9e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  36.57 
 
 		 518 aa  127  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  36.52 
 
 		 506 aa  125  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  29.97 
 
 		 346 aa  125  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  37.64 
 
 		 223 aa  124  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  35.45 
 
 		 275 aa  123  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  38.95 
 
 		 710 aa  120  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  33.45 
 
 		 394 aa  120  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  36.76 
 
 		 907 aa  119  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  34.71 
 
 		 1821 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  32.82 
 
 		 277 aa  116  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  30.69 
 
 		 218 aa  115  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  32.78 
 
 		 526 aa  115  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  36.96 
 
 		 608 aa  115  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  35.87 
 
 		 306 aa  115  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  36.16 
 
 		 1260 aa  113  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  35.06 
 
 		 625 aa  112  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  33.52 
 
 		 573 aa  112  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  36.63 
 
 		 1013 aa  112  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  34.69 
 
 		 271 aa  111  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  32.55 
 
 		 263 aa  108  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  34.09 
 
 		 4630 aa  108  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  35.71 
 
 		 457 aa  108  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  31.29 
 
 		 1174 aa  108  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  33.89 
 
 		 685 aa  108  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  33.85 
 
 		 260 aa  108  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  33.69 
 
 		 935 aa  107  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  30.68 
 
 		 449 aa  107  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>