128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4533 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 306 aa  622  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  37.13 
 
 		 907 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  40.45 
 
 		 427 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  38.2 
 
 		 608 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  34.77 
 
 		 320 aa  168  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  34.88 
 
 		 465 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  33.84 
 
 		 475 aa  162  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  35.82 
 
 		 686 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  32.96 
 
 		 426 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  33.19 
 
 		 281 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.87 
 
 		 1290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  34.18 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.29 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  37.08 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  35.87 
 
 		 1321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  33.46 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 		 641 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 		 642 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  32.97 
 
 		 883 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  33.91 
 
 		 291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.52 
 
 		 627 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  31.07 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  37.85 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  28.78 
 
 		 409 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  28.25 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.23 
 
 		 282 aa  105  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  27.76 
 
 		 694 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  37.5 
 
 		 423 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.47 
 
 		 633 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.33 
 
 		 288 aa  103  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.69 
 
 		 742 aa  102  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  35.68 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  31.49 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  35.14 
 
 		 588 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.26 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  28.99 
 
 		 286 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  33.91 
 
 		 1332 aa  96.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  28.38 
 
 		 556 aa  95.1  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  31.05 
 
 		 286 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.66 
 
 		 1694 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  29.08 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  30.4 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  28.33 
 
 		 503 aa  94  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  31.91 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  29.37 
 
 		 330 aa  93.2  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.3 
 
 		 358 aa  92.8  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.71 
 
 		 532 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.76 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  35.63 
 
 		 286 aa  89  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.41 
 
 		 912 aa  88.2  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  32.29 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  31.28 
 
 		 277 aa  87  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  28.71 
 
 		 284 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.33 
 
 		 290 aa  87  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  29.47 
 
 		 1028 aa  85.9  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  28.02 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  29.02 
 
 		 1059 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  25 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.85 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  26.37 
 
 		 449 aa  83.2  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  29.9 
 
 		 384 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  33.52 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.81 
 
 		 547 aa  82  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  24.81 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.06 
 
 		 819 aa  79.7  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  28.52 
 
 		 569 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.3 
 
 		 884 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  30.34 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  35.47 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  30.73 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  26.48 
 
 		 1918 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  29.71 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  31.16 
 
 		 842 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.08 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1873  glycoside hydrolase family 16  29.13 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  28.57 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0392  glycoside hydrolase family 16  28.1 
 
 		 691 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  29.35 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  26.29 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  35.05 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  26.82 
 
 		 1707 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  24.26 
 
 		 722 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3131  glycoside hydrolase family protein  29.35 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  27.92 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  28.97 
 
 		 388 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  27.18 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  30.57 
 
 		 486 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  28.14 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  25.89 
 
 		 752 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  27.16 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3037  glycoside hydrolase family 16  30.22 
 
 		 300 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0766336  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0446  glycoside hydrolase family protein  26.59 
 
 		 287 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3145  glycoside hydrolase family 16  30.22 
 
 		 300 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544499  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  26.32 
 
 		 1441 aa  52.4  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0298  glycoside hydrolase family protein  27.75 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10320  beta-1,3-glucanase precursor  28.87 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132676  normal  0.819711 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2590  hypothetical protein  24.91 
 
 		 807 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  unclonable  0.000225321  unclonable  0.00000000206115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4126  glycoside hydrolase family 16  31.21 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0487272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  27.95 
 
 		 464 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>