99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0560 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 		 263 aa  542  1e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  55.71 
 
 		 277 aa  311  4.999999999999999e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.21 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  29.74 
 
 		 389 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  30.86 
 
 		 274 aa  115  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  32.58 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  32.3 
 
 		 1321 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  27.21 
 
 		 276 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  32 
 
 		 301 aa  106  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  31.89 
 
 		 883 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  29.27 
 
 		 383 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  32.57 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  30.99 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  29.14 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.1 
 
 		 532 aa  99.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  27.8 
 
 		 286 aa  99.8  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  29.02 
 
 		 289 aa  99.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.01 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  28.74 
 
 		 642 aa  96.3  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  28.35 
 
 		 641 aa  96.3  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  27.42 
 
 		 409 aa  95.9  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.17 
 
 		 742 aa  95.1  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  30.54 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  30.12 
 
 		 426 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  28.36 
 
 		 503 aa  93.2  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.15 
 
 		 290 aa  92.8  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  27.46 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  29.15 
 
 		 423 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.8 
 
 		 627 aa  89.4  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  28.33 
 
 		 556 aa  89  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 427 aa  89  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.15 
 
 		 1290 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.79 
 
 		 358 aa  88.2  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.97 
 
 		 884 aa  87.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  26.35 
 
 		 469 aa  87  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.22 
 
 		 282 aa  86.3  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  26.94 
 
 		 569 aa  85.5  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.38 
 
 		 912 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  24.82 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  28.33 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.38 
 
 		 633 aa  83.2  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.8 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  31.28 
 
 		 588 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  25.95 
 
 		 1332 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 608 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  29.5 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  26.77 
 
 		 694 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  26.39 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 		 907 aa  79.7  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  25.41 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.53 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  27.37 
 
 		 1918 aa  76.6  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  31.43 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  32.09 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.97 
 
 		 1694 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  23.9 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  25.59 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.19 
 
 		 819 aa  70.1  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.9 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.06 
 
 		 547 aa  68.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  25.2 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  25.6 
 
 		 475 aa  65.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  23.61 
 
 		 752 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  27.52 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  25.1 
 
 		 1028 aa  63.2  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  23.71 
 
 		 405 aa  62.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  28.65 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  29.53 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  24.79 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  25.68 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  24.59 
 
 		 842 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  25.38 
 
 		 449 aa  58.9  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  24.85 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  24.5 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  22.03 
 
 		 722 aa  56.6  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 		 384 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  24.67 
 
 		 477 aa  55.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  24.39 
 
 		 465 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  22.52 
 
 		 1059 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  25.15 
 
 		 446 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3726  glycosy hydrolase family protein  25.81 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  29.81 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  21.57 
 
 		 1707 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0392  glycoside hydrolase family 16  24.39 
 
 		 691 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1017  glycoside hydrolase family 16  23.46 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  26.63 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0298  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0416  twin-arginine translocation pathway signal  27.45 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0404  glycoside hydrolase family protein  27.45 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.131377  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0425  glycoside hydrolase family protein  27.45 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.9 
 
 		 1007 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1873  glycoside hydrolase family 16  25.5 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  24.12 
 
 		 686 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10320  beta-1,3-glucanase precursor  25.99 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132676  normal  0.819711 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  26.88 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0446  glycoside hydrolase family protein  21.86 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511543  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>