102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0284 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 
256 aa  525  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  34.26 
 
 
426 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  37.65 
 
 
289 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.4 
 
 
261 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  34.23 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  35.74 
 
 
423 aa  88.6  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  33.06 
 
 
279 aa  85.9  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  32.78 
 
 
291 aa  85.1  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
556 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  34.98 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.77 
 
 
819 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  35.51 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  31.75 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  32.69 
 
 
588 aa  82  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  31.76 
 
 
503 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.78 
 
 
1290 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  30.48 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.29 
 
 
912 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.11 
 
 
742 aa  79  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  32.93 
 
 
883 aa  79  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  35.34 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 
694 aa  77  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  32.03 
 
 
1321 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  32.22 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  29.84 
 
 
1441 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  33.49 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  31.72 
 
 
641 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.54 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  31.72 
 
 
642 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  28.68 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.92 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  28.31 
 
 
389 aa  72  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.11 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  29.07 
 
 
449 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.17 
 
 
884 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  28.39 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.53 
 
 
627 aa  69.7  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  27.08 
 
 
1059 aa  69.3  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.58 
 
 
633 aa  69.3  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  30 
 
 
409 aa  68.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  29.34 
 
 
383 aa  68.6  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  29.8 
 
 
384 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.69 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  29.53 
 
 
469 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.97 
 
 
547 aa  68.2  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  28.67 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.49 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  28 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  29.41 
 
 
1028 aa  67  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  26.62 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.11 
 
 
532 aa  66.6  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  30.83 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.89 
 
 
1694 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  28.68 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.73 
 
 
328 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0298  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  27.68 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  28.27 
 
 
269 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  37.19 
 
 
1918 aa  63.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  29.48 
 
 
467 aa  63.2  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  29.48 
 
 
470 aa  62.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  29.96 
 
 
446 aa  62  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  27.18 
 
 
464 aa  62  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  27.82 
 
 
394 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.75 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0416  twin-arginine translocation pathway signal  29.96 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0425  glycoside hydrolase family protein  29.96 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0404  glycoside hydrolase family protein  29.96 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.131377  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  28.36 
 
 
479 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  29.25 
 
 
479 aa  60.1  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.11 
 
 
815 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.81 
 
 
1007 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.73 
 
 
290 aa  58.9  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  28.63 
 
 
722 aa  58.9  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  24.55 
 
 
313 aa  58.9  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  29.32 
 
 
334 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0446  glycoside hydrolase family protein  29.92 
 
 
287 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511543  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  31.76 
 
 
569 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  28.4 
 
 
1707 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  30.89 
 
 
308 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  28.67 
 
 
1332 aa  55.8  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  31.95 
 
 
319 aa  54.7  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  28.32 
 
 
318 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0144  glycoside hydrolase family 16  34.13 
 
 
337 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.568109  normal  0.0389127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  31.44 
 
 
752 aa  52.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10320  beta-1,3-glucanase precursor  28.86 
 
 
294 aa  52  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132676  normal  0.819711 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  27.88 
 
 
469 aa  52  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  29 
 
 
639 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  30.92 
 
 
306 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  31.58 
 
 
320 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  29.81 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  31.58 
 
 
475 aa  50.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  28.74 
 
 
277 aa  49.7  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  24.91 
 
 
388 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38794  predicted protein  42 
 
 
541 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  27.51 
 
 
465 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  28.15 
 
 
999 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  27.37 
 
 
295 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4126  glycoside hydrolase family 16  28.26 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0487272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  26.15 
 
 
539 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>