272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1538 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 
423 aa  862    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  85.02 
 
 
289 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  52.07 
 
 
426 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  63.22 
 
 
283 aa  317  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  58.47 
 
 
291 aa  262  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  47 
 
 
279 aa  243  5e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  47.13 
 
 
1290 aa  239  8e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  49.8 
 
 
588 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  44.04 
 
 
641 aa  238  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  44.04 
 
 
642 aa  238  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  46.99 
 
 
281 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  45.04 
 
 
282 aa  223  4e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  46.8 
 
 
627 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  44.13 
 
 
1321 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  43.37 
 
 
274 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  46.33 
 
 
883 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  47.97 
 
 
569 aa  210  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  42.39 
 
 
286 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  43.54 
 
 
633 aa  206  7e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  45.34 
 
 
276 aa  201  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.06 
 
 
288 aa  201  3e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  46.44 
 
 
556 aa  197  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  40.89 
 
 
384 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  43.75 
 
 
389 aa  196  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  44.44 
 
 
383 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  36.83 
 
 
503 aa  193  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  45.32 
 
 
271 aa  189  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  40.66 
 
 
252 aa  189  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  42.42 
 
 
1028 aa  185  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  40.43 
 
 
328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  44.07 
 
 
269 aa  183  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  36.5 
 
 
446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  46.59 
 
 
260 aa  182  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  40.71 
 
 
409 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  35.8 
 
 
394 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  41.32 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.64 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.46 
 
 
884 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.31 
 
 
912 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.43 
 
 
815 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.98 
 
 
742 aa  169  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.23 
 
 
358 aa  169  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  41.84 
 
 
238 aa  166  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.99 
 
 
532 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  36.99 
 
 
469 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  34.64 
 
 
330 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  34.81 
 
 
694 aa  159  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  39.08 
 
 
286 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  40.59 
 
 
1332 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.11 
 
 
1694 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 
291 aa  152  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  37.82 
 
 
1059 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.66 
 
 
328 aa  149  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  40.71 
 
 
752 aa  146  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  36.05 
 
 
479 aa  145  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.92 
 
 
547 aa  143  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  34.68 
 
 
346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  37.5 
 
 
470 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  35.37 
 
 
1918 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.65 
 
 
315 aa  138  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  38.1 
 
 
479 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  34.16 
 
 
464 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  38.52 
 
 
1441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.67 
 
 
306 aa  129  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  41.29 
 
 
427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.23 
 
 
819 aa  126  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.1 
 
 
290 aa  124  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.88 
 
 
1072 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  35.48 
 
 
467 aa  119  9e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  48.36 
 
 
634 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  36.36 
 
 
318 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  32.36 
 
 
405 aa  116  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  36.78 
 
 
320 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  49.14 
 
 
373 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  35.21 
 
 
469 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  32.49 
 
 
313 aa  112  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  47.86 
 
 
492 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  31.53 
 
 
608 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  33.45 
 
 
388 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  50 
 
 
1128 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  37.1 
 
 
306 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  48.41 
 
 
384 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  33.45 
 
 
308 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  44.03 
 
 
890 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  47.86 
 
 
1207 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  49.25 
 
 
391 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  32.02 
 
 
722 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  38.1 
 
 
801 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.48 
 
 
933 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  33.84 
 
 
286 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.55 
 
 
1007 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.65 
 
 
627 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  46.46 
 
 
417 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  48.85 
 
 
516 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  29.47 
 
 
907 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  46.03 
 
 
732 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  31.32 
 
 
449 aa  99.8  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  44.53 
 
 
488 aa  99.8  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  43.75 
 
 
522 aa  99.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.79 
 
 
639 aa  97.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>