120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54681 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  100 
 
 
1028 aa  2104    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  31.78 
 
 
1332 aa  218  5.9999999999999996e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  40.16 
 
 
281 aa  182  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  38.36 
 
 
423 aa  181  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  40.65 
 
 
291 aa  182  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.79 
 
 
252 aa  178  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  39.15 
 
 
883 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  41.13 
 
 
279 aa  174  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.99 
 
 
627 aa  171  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  40.87 
 
 
383 aa  171  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  39.84 
 
 
289 aa  170  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  38.67 
 
 
276 aa  168  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  37.26 
 
 
642 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  37.26 
 
 
641 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  38.55 
 
 
1321 aa  166  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  39.52 
 
 
274 aa  165  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  40.93 
 
 
283 aa  164  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  35.45 
 
 
328 aa  164  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  38.95 
 
 
409 aa  163  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  38.75 
 
 
286 aa  162  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  35.9 
 
 
389 aa  161  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.55 
 
 
1694 aa  161  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.2 
 
 
633 aa  160  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  38.43 
 
 
503 aa  159  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.79 
 
 
742 aa  159  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.27 
 
 
912 aa  159  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  40.54 
 
 
426 aa  155  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  35.14 
 
 
694 aa  153  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.71 
 
 
884 aa  152  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.43 
 
 
288 aa  150  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.15 
 
 
358 aa  149  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  34.68 
 
 
1918 aa  149  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.9 
 
 
1290 aa  148  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.37 
 
 
532 aa  147  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  35.23 
 
 
291 aa  146  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.61 
 
 
282 aa  145  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  37.25 
 
 
301 aa  145  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  35.61 
 
 
330 aa  144  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  36.47 
 
 
569 aa  142  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  34.33 
 
 
469 aa  140  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  33.46 
 
 
1059 aa  138  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  34.54 
 
 
286 aa  134  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  35.34 
 
 
752 aa  134  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  34.34 
 
 
588 aa  134  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  36.33 
 
 
556 aa  130  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.26 
 
 
328 aa  129  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  34.23 
 
 
238 aa  127  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.42 
 
 
306 aa  126  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  36.14 
 
 
271 aa  126  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.59 
 
 
315 aa  122  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 
384 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.56 
 
 
819 aa  114  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  29.17 
 
 
1707 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 
260 aa  109  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.15 
 
 
290 aa  107  9e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  29.72 
 
 
269 aa  107  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  31.79 
 
 
405 aa  107  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  33.94 
 
 
467 aa  104  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  30.34 
 
 
477 aa  102  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  31.27 
 
 
1441 aa  102  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  27.76 
 
 
427 aa  100  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  32.93 
 
 
320 aa  97.8  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  28.72 
 
 
394 aa  95.9  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.03 
 
 
547 aa  95.9  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  31.09 
 
 
334 aa  95.1  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.77 
 
 
261 aa  95.1  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  31.11 
 
 
308 aa  92  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  30.86 
 
 
449 aa  89.4  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  31.44 
 
 
464 aa  88.6  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  31.48 
 
 
479 aa  88.2  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  27.47 
 
 
319 aa  88.2  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  31.27 
 
 
470 aa  88.2  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  28.77 
 
 
306 aa  88.2  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  30.63 
 
 
318 aa  86.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  31.84 
 
 
722 aa  86.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  29.96 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.4 
 
 
915 aa  84.7  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  31.52 
 
 
479 aa  83.2  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  31.06 
 
 
608 aa  83.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  29.59 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  26.97 
 
 
907 aa  81.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0144  glycoside hydrolase family 16  32 
 
 
337 aa  80.1  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.568109  normal  0.0389127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  29.24 
 
 
539 aa  80.1  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  29.43 
 
 
275 aa  79.3  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  25.81 
 
 
277 aa  77.4  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  28.68 
 
 
346 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  31.9 
 
 
295 aa  75.9  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  29.29 
 
 
277 aa  73.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  26.49 
 
 
313 aa  70.1  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  28.5 
 
 
446 aa  69.3  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1873  glycoside hydrolase family 16  29.15 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  28.93 
 
 
256 aa  67.4  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.97 
 
 
1007 aa  65.1  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6178  glycoside hydrolase family 16  27.24 
 
 
329 aa  65.1  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  25.23 
 
 
465 aa  64.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  26.34 
 
 
475 aa  64.3  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  25.1 
 
 
263 aa  62.8  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2850  hypothetical protein  33.66 
 
 
915 aa  61.6  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 
1184 aa  61.2  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  29.48 
 
 
486 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>