143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0921 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  98.28 
 
 
641 aa  1293    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
642 aa  1315    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  49.38 
 
 
627 aa  620  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  46.03 
 
 
1290 aa  541  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  62.77 
 
 
281 aa  340  4e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  59.36 
 
 
282 aa  302  1e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  54.76 
 
 
288 aa  276  1.0000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  39.86 
 
 
1321 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  54.66 
 
 
291 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  49.82 
 
 
279 aa  262  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  50.6 
 
 
289 aa  246  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  48.21 
 
 
423 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  49.21 
 
 
283 aa  231  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  48.87 
 
 
633 aa  231  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  35.44 
 
 
883 aa  226  8e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  47.64 
 
 
426 aa  220  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  45.38 
 
 
588 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  47.83 
 
 
274 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  43.87 
 
 
383 aa  214  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  45.25 
 
 
389 aa  213  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  45.45 
 
 
569 aa  211  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1241  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  58.17 
 
 
351 aa  200  6e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00026508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  45.53 
 
 
301 aa  200  7e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  43.46 
 
 
276 aa  197  6e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.45 
 
 
252 aa  195  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  40.83 
 
 
328 aa  191  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  45.34 
 
 
286 aa  188  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  41.77 
 
 
556 aa  186  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.41 
 
 
1694 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  40 
 
 
503 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  39.84 
 
 
409 aa  178  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  32.51 
 
 
1918 aa  177  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  39.31 
 
 
1059 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  36.08 
 
 
384 aa  171  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.13 
 
 
358 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.71 
 
 
912 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.98 
 
 
884 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  37.26 
 
 
1028 aa  167  8e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.35 
 
 
742 aa  166  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.93 
 
 
532 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  37.59 
 
 
694 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  38.21 
 
 
330 aa  163  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  36.1 
 
 
1332 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  39.27 
 
 
238 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.66 
 
 
819 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  39.27 
 
 
286 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  35.43 
 
 
469 aa  154  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  34.36 
 
 
752 aa  154  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.11 
 
 
328 aa  150  8e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  34.26 
 
 
394 aa  147  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.68 
 
 
547 aa  144  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.12 
 
 
261 aa  144  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  35.07 
 
 
313 aa  143  8e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  33.45 
 
 
291 aa  143  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.82 
 
 
306 aa  143  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  36.77 
 
 
271 aa  141  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  35.55 
 
 
269 aa  138  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.4 
 
 
290 aa  137  8e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  30.06 
 
 
405 aa  136  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  34.83 
 
 
275 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  35.36 
 
 
286 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.22 
 
 
315 aa  135  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  39.71 
 
 
427 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  36.88 
 
 
308 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  38.38 
 
 
320 aa  127  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  36.06 
 
 
1441 aa  126  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  33.04 
 
 
467 aa  124  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  37.79 
 
 
260 aa  122  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  32.33 
 
 
1707 aa  118  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  31.36 
 
 
477 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  31.21 
 
 
346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 
306 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  32.01 
 
 
318 aa  111  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  30.58 
 
 
465 aa  111  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  31.79 
 
 
479 aa  110  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  31.54 
 
 
479 aa  110  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  30.8 
 
 
334 aa  108  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  31.9 
 
 
470 aa  107  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  28.57 
 
 
277 aa  103  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  36.16 
 
 
608 aa  103  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  31.02 
 
 
388 aa  101  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  28.88 
 
 
464 aa  101  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  30.18 
 
 
539 aa  97.4  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  33.52 
 
 
907 aa  96.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  28.74 
 
 
263 aa  96.3  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  30.32 
 
 
469 aa  96.3  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  29.28 
 
 
449 aa  95.5  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.24 
 
 
639 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  35.39 
 
 
295 aa  90.9  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.89 
 
 
1007 aa  90.5  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  29.46 
 
 
475 aa  88.6  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  26.4 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0555  laminarinase  34 
 
 
196 aa  79.3  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  36.17 
 
 
1414 aa  78.2  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  30.54 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 
1184 aa  77  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0144  glycoside hydrolase family 16  27.21 
 
 
337 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.568109  normal  0.0389127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  27.53 
 
 
446 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  26.2 
 
 
288 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2825  glycoside hydrolase family protein  29.08 
 
 
492 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>