154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2285 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 		 539 aa  1067    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  54.36 
 
 		 318 aa  310  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  51.61 
 
 		 464 aa  309  9e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  53.68 
 
 		 470 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  54.58 
 
 		 479 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  51.03 
 
 		 479 aa  295  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.18 
 
 		 639 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  45.14 
 
 		 469 aa  220  5e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.86 
 
 		 1007 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  45.22 
 
 		 446 aa  189  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  41.02 
 
 		 999 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  38.81 
 
 		 388 aa  160  7e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.58 
 
 		 815 aa  143  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2395  Fibronectin type III domain protein  50.28 
 
 		 844 aa  139  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527977  decreased coverage  0.000101055 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00031  conserved hypothetical protein  31.29 
 
 		 361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.096778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  36.23 
 
 		 383 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  31.11 
 
 		 279 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  31.18 
 
 		 389 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  32.62 
 
 		 409 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  32.34 
 
 		 556 aa  98.2  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  30.18 
 
 		 641 aa  97.8  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  30.18 
 
 		 642 aa  98.2  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  31.72 
 
 		 276 aa  97.1  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  33.89 
 
 		 405 aa  94  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.6 
 
 		 261 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  32.59 
 
 		 291 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  30.18 
 
 		 301 aa  90.9  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  28.99 
 
 		 467 aa  90.1  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  29.97 
 
 		 330 aa  89  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.77 
 
 		 633 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  30.21 
 
 		 289 aa  88.2  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.9 
 
 		 1290 aa  87.8  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  28.73 
 
 		 281 aa  87  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  29.43 
 
 		 286 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.55 
 
 		 547 aa  84.3  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  28.72 
 
 		 384 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  29.21 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  30.58 
 
 		 274 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  29.6 
 
 		 1028 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.9 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  26.54 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  34.36 
 
 		 2170 aa  80.9  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  43.9 
 
 		 648 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  30.5 
 
 		 283 aa  79.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  33.33 
 
 		 456 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.32 
 
 		 627 aa  79  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  24.76 
 
 		 503 aa  78.6  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  29.82 
 
 		 752 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  28.08 
 
 		 883 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  28.21 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  32.61 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  32.98 
 
 		 762 aa  76.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  29.43 
 
 		 1059 aa  76.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  29.12 
 
 		 588 aa  76.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.96 
 
 		 252 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.39 
 
 		 819 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.53 
 
 		 912 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.3 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  29.79 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  29.26 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  31.36 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  29.26 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  29.26 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  30.15 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.76 
 
 		 1694 aa  73.6  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  28.72 
 
 		 455 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  27.19 
 
 		 394 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  29.26 
 
 		 455 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  28.3 
 
 		 291 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  29.44 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.06 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  31.28 
 
 		 569 aa  71.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  30.98 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  30.98 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  27.39 
 
 		 1321 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.23 
 
 		 6885 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  32.42 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  31.15 
 
 		 458 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  31.15 
 
 		 458 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  27.72 
 
 		 1918 aa  68.6  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  30.81 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.56 
 
 		 742 aa  67.4  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.5 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  29.69 
 
 		 459 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  29.15 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  26.25 
 
 		 319 aa  66.2  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.87 
 
 		 884 aa  64.7  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  34.88 
 
 		 743 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  35.71 
 
 		 1462 aa  64.3  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  25.19 
 
 		 694 aa  63.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  29.03 
 
 		 598 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  26.62 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  24.07 
 
 		 722 aa  62  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  25.34 
 
 		 313 aa  62  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  25.74 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.14 
 
 		 532 aa  61.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.76 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  31.76 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  28.27 
 
 		 1332 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  27.47 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>