More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4881 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  100 
 
 
743 aa  1481    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  68.45 
 
 
633 aa  620  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  50.19 
 
 
655 aa  503  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  54.36 
 
 
1209 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  46.89 
 
 
548 aa  426  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  50.56 
 
 
1128 aa  415  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  49.22 
 
 
572 aa  412  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  46.82 
 
 
623 aa  397  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.24 
 
 
646 aa  399  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.51 
 
 
639 aa  394  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  46.49 
 
 
628 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  42.79 
 
 
767 aa  345  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  42.82 
 
 
791 aa  327  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  41.72 
 
 
611 aa  321  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  42.06 
 
 
596 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.27 
 
 
452 aa  303  7.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000458427  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  41.69 
 
 
620 aa  301  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  41.57 
 
 
589 aa  298  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  41.56 
 
 
605 aa  294  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  39.86 
 
 
588 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  39.86 
 
 
590 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  62.76 
 
 
973 aa  280  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  58.16 
 
 
608 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  58.06 
 
 
460 aa  193  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  53.39 
 
 
1121 aa  181  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  34.82 
 
 
393 aa  177  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.951317 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  35.22 
 
 
450 aa  177  8e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  50.49 
 
 
1137 aa  171  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  53.16 
 
 
2170 aa  164  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  51.02 
 
 
998 aa  162  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  43.89 
 
 
938 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.15 
 
 
6885 aa  156  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  55.49 
 
 
727 aa  153  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  44.04 
 
 
455 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  46.73 
 
 
681 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  44.74 
 
 
455 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  44.88 
 
 
455 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  44.5 
 
 
456 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  42.56 
 
 
459 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  43.16 
 
 
455 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  42.11 
 
 
455 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  43.16 
 
 
455 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  42.11 
 
 
455 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  47.74 
 
 
880 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  42.63 
 
 
455 aa  139  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  46.15 
 
 
543 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  40.49 
 
 
455 aa  138  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  42.63 
 
 
458 aa  137  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  41.12 
 
 
847 aa  137  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  40.49 
 
 
458 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  33.6 
 
 
680 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  39.22 
 
 
456 aa  135  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  41.58 
 
 
455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  40.93 
 
 
455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  43.5 
 
 
978 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  43.69 
 
 
658 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  37.85 
 
 
1007 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  45.41 
 
 
1887 aa  131  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  48.76 
 
 
429 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.5 
 
 
1448 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  46.02 
 
 
809 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  46.74 
 
 
854 aa  124  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5296  hypothetical protein  34.91 
 
 
385 aa  124  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  39.58 
 
 
637 aa  124  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  57.43 
 
 
562 aa  122  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  41.55 
 
 
762 aa  121  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  61.39 
 
 
763 aa  121  6e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  48.24 
 
 
649 aa  120  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.93 
 
 
729 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  39.19 
 
 
561 aa  119  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  58.82 
 
 
403 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  42.38 
 
 
523 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  44.63 
 
 
543 aa  114  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  40.21 
 
 
2286 aa  114  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  35.03 
 
 
674 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  34.52 
 
 
674 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  34.52 
 
 
674 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  42.41 
 
 
445 aa  108  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  34.01 
 
 
674 aa  108  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  34.52 
 
 
674 aa  108  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  34.52 
 
 
674 aa  108  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  44.16 
 
 
900 aa  107  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  36.07 
 
 
674 aa  107  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  40.33 
 
 
438 aa  107  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  36.07 
 
 
674 aa  107  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  36.07 
 
 
465 aa  107  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  34.01 
 
 
674 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  42.78 
 
 
997 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  34.04 
 
 
464 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  33.5 
 
 
674 aa  103  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  58.43 
 
 
1298 aa  102  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  34.52 
 
 
803 aa  101  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  56.38 
 
 
420 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  40.35 
 
 
768 aa  100  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  53.26 
 
 
436 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  31.65 
 
 
598 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  61.11 
 
 
924 aa  98.2  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  38.66 
 
 
679 aa  97.8  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  51.49 
 
 
494 aa  97.8  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  49.04 
 
 
984 aa  97.4  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>