220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3983 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  63.69 
 
 		 596 aa  688    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  59.86 
 
 		 611 aa  665    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  86.4 
 
 		 620 aa  1051    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  57.89 
 
 		 588 aa  665    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 589 aa  1204    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  59.42 
 
 		 590 aa  665    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  54.82 
 
 		 605 aa  625  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  67.83 
 
 		 452 aa  607  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000458427  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  62.24 
 
 		 767 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  52.06 
 
 		 655 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  48.42 
 
 		 623 aa  402  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  48.6 
 
 		 1128 aa  402  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  48.47 
 
 		 791 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  48.31 
 
 		 548 aa  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.38 
 
 		 646 aa  373  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.5 
 
 		 639 aa  369  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  45.91 
 
 		 572 aa  361  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  46.22 
 
 		 1209 aa  349  7e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  43.47 
 
 		 628 aa  348  2e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.15 
 
 		 633 aa  315  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  41.72 
 
 		 743 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  31.42 
 
 		 393 aa  161  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  57.81 
 
 		 979 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  34.58 
 
 		 450 aa  148  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  29.63 
 
 		 469 aa  139  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  31.02 
 
 		 459 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  58.41 
 
 		 785 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  49.64 
 
 		 963 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  53.85 
 
 		 966 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  57.69 
 
 		 998 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  27.99 
 
 		 446 aa  120  7.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  50.88 
 
 		 491 aa  114  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  48.39 
 
 		 488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  53.4 
 
 		 854 aa  109  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  47.79 
 
 		 479 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  53.4 
 
 		 690 aa  109  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  42.34 
 
 		 669 aa  107  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  56.44 
 
 		 880 aa  106  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  52.48 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  46.49 
 
 		 743 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  50 
 
 		 420 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  52.88 
 
 		 489 aa  104  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  50.48 
 
 		 775 aa  103  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  50 
 
 		 681 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  49.06 
 
 		 990 aa  101  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  49.04 
 
 		 727 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  48.51 
 
 		 934 aa  99.8  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  48.31 
 
 		 533 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  48.54 
 
 		 494 aa  98.6  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  41.53 
 
 		 609 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  48.04 
 
 		 842 aa  97.8  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.62 
 
 		 984 aa  97.4  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  48.51 
 
 		 423 aa  96.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  44.55 
 
 		 376 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  46.6 
 
 		 688 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  46.73 
 
 		 746 aa  95.9  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  46 
 
 		 1007 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  45.63 
 
 		 778 aa  94.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  30.15 
 
 		 469 aa  94.4  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  38.46 
 
 		 439 aa  94.4  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  39.57 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  45.63 
 
 		 518 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  48.45 
 
 		 485 aa  93.2  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  49.45 
 
 		 938 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  42.64 
 
 		 875 aa  92.8  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  38.93 
 
 		 455 aa  92.8  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  28.14 
 
 		 419 aa  92  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  42.48 
 
 		 1055 aa  89.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  44.66 
 
 		 487 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  44.12 
 
 		 488 aa  89  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  43.93 
 
 		 719 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  46.15 
 
 		 774 aa  89  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  39.44 
 
 		 633 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  44.44 
 
 		 744 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  39.55 
 
 		 495 aa  88.6  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 854 aa  88.6  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  45.1 
 
 		 580 aa  88.2  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  43.14 
 
 		 894 aa  88.2  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  43 
 
 		 597 aa  88.2  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  43.93 
 
 		 499 aa  87.8  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  41.51 
 
 		 913 aa  87.8  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  40.19 
 
 		 812 aa  87.4  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  44.14 
 
 		 679 aa  87  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  45.1 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  41.58 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  44.66 
 
 		 794 aa  85.9  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  41.53 
 
 		 525 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  53.51 
 
 		 829 aa  85.1  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  36.13 
 
 		 974 aa  84  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  41.35 
 
 		 846 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  43.69 
 
 		 925 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  46.81 
 
 		 598 aa  82.8  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  40.18 
 
 		 773 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  43.56 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  43.69 
 
 		 851 aa  81.6  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  38.14 
 
 		 842 aa  80.9  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  40.91 
 
 		 894 aa  80.1  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5296  hypothetical protein  36.54 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  27.84 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  41.35 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>