237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1868 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  64.25 
 
 		 669 aa  806    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  67.83 
 
 		 743 aa  981    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  57.48 
 
 		 914 aa  662    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  54.3 
 
 		 1065 aa  637    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  53.98 
 
 		 1266 aa  643    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  63.22 
 
 		 820 aa  736    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  69.07 
 
 		 774 aa  777    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  62.31 
 
 		 773 aa  965    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  57.66 
 
 		 676 aa  684    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  55.3 
 
 		 833 aa  635    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  63.59 
 
 		 746 aa  878    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  100 
 
 		 744 aa  1491    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0215  hypothetical protein  53.33 
 
 		 787 aa  631  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.247973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3413  FG-GAP repeat protein  51.82 
 
 		 672 aa  608  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3679  FG-GAP repeat-containing protein  51.99 
 
 		 677 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000668501  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  51.16 
 
 		 1880 aa  592  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1678  FG-GAP repeat-containing protein  49.92 
 
 		 618 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000385209  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3891  FG-GAP repeat protein  49.16 
 
 		 662 aa  564  1.0000000000000001e-159  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0201045  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1343  YesW  50.08 
 
 		 658 aa  559  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3890  FG-GAP repeat protein  48.03 
 
 		 613 aa  542  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.100975  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4222  FG-GAP repeat-containing protein  47.83 
 
 		 616 aa  534  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  39.4 
 
 		 848 aa  375  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2008  putative secreted glycosyl hydrolase  71.97 
 
 		 240 aa  362  1e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3493  FG-GAP repeat protein  43 
 
 		 767 aa  276  9e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.832541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25650  FG-GAP repeat protein  41.06 
 
 		 1082 aa  270  8e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112985  normal  0.313827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0343  FG-GAP repeat-containing protein  38.33 
 
 		 803 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0488  FG-GAP repeat protein  40.8 
 
 		 851 aa  255  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02543  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  31.47 
 
 		 606 aa  218  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  61.9 
 
 		 681 aa  136  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  57.66 
 
 		 459 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  51.06 
 
 		 605 aa  128  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  53.98 
 
 		 488 aa  127  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  47.1 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  55.14 
 
 		 499 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  52.73 
 
 		 491 aa  119  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  53.33 
 
 		 469 aa  118  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.71 
 
 		 479 aa  117  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  52.43 
 
 		 611 aa  114  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  50.44 
 
 		 785 aa  111  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  50 
 
 		 485 aa  111  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.33 
 
 		 979 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  47.57 
 
 		 438 aa  109  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  47.32 
 
 		 974 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  50 
 
 		 596 aa  108  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  47.54 
 
 		 767 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  47.52 
 
 		 446 aa  107  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  43.64 
 
 		 1055 aa  105  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  38.1 
 
 		 633 aa  105  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.33 
 
 		 984 aa  103  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  52.48 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  40.58 
 
 		 963 aa  103  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  48.54 
 
 		 495 aa  102  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  47.17 
 
 		 990 aa  101  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  43.14 
 
 		 628 aa  101  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  43.59 
 
 		 966 aa  100  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.23 
 
 		 588 aa  99  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  42.98 
 
 		 864 aa  97.8  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  44.96 
 
 		 366 aa  97.4  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  46.6 
 
 		 423 aa  97.4  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  44.83 
 
 		 942 aa  97.4  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  43.27 
 
 		 590 aa  97.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  48.51 
 
 		 442 aa  96.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  45.54 
 
 		 906 aa  96.3  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  50.55 
 
 		 456 aa  96.3  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  46.53 
 
 		 436 aa  95.9  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  35.71 
 
 		 455 aa  95.9  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  51.14 
 
 		 422 aa  95.5  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  45.63 
 
 		 925 aa  95.1  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  47.06 
 
 		 934 aa  95.5  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  45.63 
 
 		 913 aa  94.7  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  46.67 
 
 		 487 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  43.28 
 
 		 589 aa  93.6  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  38.52 
 
 		 812 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  37.82 
 
 		 846 aa  92.8  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  47.52 
 
 		 429 aa  92.8  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.24 
 
 		 998 aa  92  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  44.76 
 
 		 489 aa  92.4  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  44.64 
 
 		 851 aa  91.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  39.25 
 
 		 609 aa  91.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  44.12 
 
 		 623 aa  90.9  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  39.37 
 
 		 620 aa  90.9  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  46.73 
 
 		 894 aa  90.1  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  44.12 
 
 		 580 aa  90.5  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  40.16 
 
 		 1042 aa  89.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  41.18 
 
 		 688 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  41.18 
 
 		 518 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  44.12 
 
 		 842 aa  89.7  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  32.12 
 
 		 854 aa  89  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  35.26 
 
 		 842 aa  89  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  38.33 
 
 		 533 aa  87.8  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  44.14 
 
 		 376 aa  87.4  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  42.45 
 
 		 420 aa  87.4  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  49.11 
 
 		 829 aa  87.4  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  47.78 
 
 		 673 aa  87.4  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  40.2 
 
 		 778 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  48.89 
 
 		 437 aa  87  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  38.32 
 
 		 1128 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  42.16 
 
 		 794 aa  86.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  51.76 
 
 		 477 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  43.56 
 
 		 597 aa  86.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>