227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1559 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  100 
 
 		 488 aa  991    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  63.36 
 
 		 829 aa  528  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  73.2 
 
 		 474 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  73.27 
 
 		 520 aa  456  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  72.52 
 
 		 492 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02632  arabinoxylan arabinofuranohydrolase (Eurofung)  70.43 
 
 		 308 aa  449  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  71.19 
 
 		 507 aa  443  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07908  arabinoxylan arabinofuranohydrolase (Eurofung)  68.39 
 
 		 325 aa  428  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.901711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  41.91 
 
 		 485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.86 
 
 		 1221 aa  211  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  40.63 
 
 		 1195 aa  209  9e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  69.64 
 
 		 743 aa  159  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  62.14 
 
 		 681 aa  140  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  62.5 
 
 		 499 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  50 
 
 		 479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  51.72 
 
 		 491 aa  131  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  57.52 
 
 		 785 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  49.62 
 
 		 744 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  47.71 
 
 		 633 aa  127  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  60.19 
 
 		 596 aa  127  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  53.33 
 
 		 495 aa  126  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  50.35 
 
 		 588 aa  123  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  37.44 
 
 		 767 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  57.28 
 
 		 611 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  55.34 
 
 		 774 aa  121  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  37.63 
 
 		 773 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  48.51 
 
 		 589 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  36.79 
 
 		 486 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  50.49 
 
 		 469 aa  117  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  51.18 
 
 		 605 aa  117  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  59.41 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.65 
 
 		 979 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  51.85 
 
 		 459 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  44.53 
 
 		 669 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  58.42 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.67 
 
 		 590 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  50.47 
 
 		 609 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  40.91 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  50 
 
 		 974 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  54.9 
 
 		 494 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  32.87 
 
 		 780 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  54.37 
 
 		 681 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  32.87 
 
 		 536 aa  110  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  43.8 
 
 		 620 aa  110  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  38.93 
 
 		 1128 aa  110  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.15 
 
 		 984 aa  108  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  40.24 
 
 		 963 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  46.49 
 
 		 1055 aa  107  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  43.28 
 
 		 854 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  46.72 
 
 		 446 aa  107  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  51.96 
 
 		 688 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  52.94 
 
 		 474 aa  107  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  51.96 
 
 		 518 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  49.52 
 
 		 628 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  48.08 
 
 		 846 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  44.14 
 
 		 812 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  50.98 
 
 		 778 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  46.73 
 
 		 746 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  49.07 
 
 		 966 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  49.52 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  46.43 
 
 		 420 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  54.26 
 
 		 1209 aa  100  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  45.63 
 
 		 913 aa  100  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  53.47 
 
 		 442 aa  99.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  47.93 
 
 		 376 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  51.96 
 
 		 934 aa  99.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  40.26 
 
 		 842 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  44.64 
 
 		 543 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  51.96 
 
 		 623 aa  98.6  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  48.11 
 
 		 990 aa  99  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  51.46 
 
 		 925 aa  98.2  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.62 
 
 		 998 aa  97.4  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  49.02 
 
 		 851 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  49.52 
 
 		 487 aa  96.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  50.98 
 
 		 580 aa  95.9  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  51.96 
 
 		 842 aa  96.3  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  46.67 
 
 		 489 aa  96.3  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  51.58 
 
 		 763 aa  95.5  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  44.55 
 
 		 906 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  47.66 
 
 		 775 aa  94.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  46.81 
 
 		 448 aa  93.6  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  48.04 
 
 		 880 aa  93.2  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  43.48 
 
 		 727 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  48.11 
 
 		 942 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  50 
 
 		 456 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  41.18 
 
 		 894 aa  91.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  51.06 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  50 
 
 		 460 aa  90.5  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  46.6 
 
 		 423 aa  90.1  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  45.1 
 
 		 935 aa  90.1  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  47.83 
 
 		 743 aa  90.1  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  48.18 
 
 		 894 aa  90.1  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  50.57 
 
 		 422 aa  90.1  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  42.06 
 
 		 864 aa  89.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  45.54 
 
 		 487 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  42.37 
 
 		 875 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  43.86 
 
 		 694 aa  87.8  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  41.38 
 
 		 1042 aa  87.4  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  45.1 
 
 		 794 aa  87.4  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  40.37 
 
 		 533 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>