277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2048 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  100 
 
 		 679 aa  1366    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  49.69 
 
 		 699 aa  624  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  40.21 
 
 		 719 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  40.08 
 
 		 727 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  40.36 
 
 		 959 aa  306  8.000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  37.58 
 
 		 483 aa  244  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  34.32 
 
 		 818 aa  211  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  42.58 
 
 		 880 aa  128  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  35.92 
 
 		 1007 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.46 
 
 		 998 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2071  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  26.37 
 
 		 535 aa  109  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  40.2 
 
 		 543 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.95 
 
 		 984 aa  100  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  36.21 
 
 		 938 aa  98.6  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  35.27 
 
 		 681 aa  94.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  54.74 
 
 		 775 aa  94  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  32.34 
 
 		 732 aa  93.6  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.63 
 
 		 484 aa  92.8  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.13 
 
 		 484 aa  92.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  43.27 
 
 		 491 aa  92  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  38.14 
 
 		 743 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  49.06 
 
 		 990 aa  91.7  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  35.34 
 
 		 978 aa  92  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  43.69 
 
 		 778 aa  91.3  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.82 
 
 		 507 aa  90.9  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  32.83 
 
 		 847 aa  90.1  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  27.07 
 
 		 525 aa  89.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  30.86 
 
 		 688 aa  88.6  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  41.9 
 
 		 364 aa  88.2  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.08 
 
 		 501 aa  87.8  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.6 
 
 		 979 aa  87.8  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  44.14 
 
 		 589 aa  87.8  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  34.47 
 
 		 637 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.8 
 
 		 521 aa  86.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  45.1 
 
 		 966 aa  85.5  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  41.44 
 
 		 620 aa  85.5  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  45.37 
 
 		 913 aa  85.9  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  45.63 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  44.66 
 
 		 925 aa  84.7  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  30.24 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.65 
 
 		 501 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  38.83 
 
 		 429 aa  83.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  41.96 
 
 		 533 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  39.25 
 
 		 628 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.32 
 
 		 548 aa  82.8  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  39.58 
 
 		 608 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  39.05 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  48.42 
 
 		 588 aa  82.8  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  43.27 
 
 		 623 aa  83.2  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  29.78 
 
 		 704 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  45.87 
 
 		 767 aa  82  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5296  hypothetical protein  30.73 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.02 
 
 		 515 aa  82.4  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  39.13 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.12 
 
 		 504 aa  81.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  43.27 
 
 		 842 aa  81.6  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.4 
 
 		 778 aa  82  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  40.57 
 
 		 894 aa  81.3  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  43.27 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.71 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  26.36 
 
 		 506 aa  80.1  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  25.42 
 
 		 505 aa  80.1  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.42 
 
 		 526 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  41.28 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  34.73 
 
 		 794 aa  79  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  42.11 
 
 		 611 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  27.41 
 
 		 527 aa  78.6  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  23.31 
 
 		 522 aa  78.6  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.08 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  42.73 
 
 		 605 aa  78.2  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  36.61 
 
 		 609 aa  78.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  36.61 
 
 		 846 aa  78.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  45.71 
 
 		 690 aa  78.2  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  44.68 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  41.18 
 
 		 596 aa  78.2  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  40.78 
 
 		 875 aa  78.2  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.65 
 
 		 499 aa  77.8  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  45.71 
 
 		 854 aa  77.8  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  37.86 
 
 		 518 aa  77.4  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.37 
 
 		 503 aa  77.4  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  40.74 
 
 		 963 aa  77.4  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  41.67 
 
 		 746 aa  76.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  25.67 
 
 		 566 aa  76.6  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  41.23 
 
 		 744 aa  76.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  21.99 
 
 		 513 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  24.17 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.79 
 
 		 501 aa  76.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.1 
 
 		 506 aa  75.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  33.94 
 
 		 455 aa  76.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  39.62 
 
 		 1128 aa  76.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  44.09 
 
 		 598 aa  76.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  30.31 
 
 		 704 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  39.81 
 
 		 525 aa  75.5  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  37.74 
 
 		 580 aa  75.1  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.39 
 
 		 646 aa  75.1  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  36.79 
 
 		 854 aa  75.1  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6365  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25.58 
 
 		 579 aa  74.7  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  39.47 
 
 		 785 aa  74.7  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  40.95 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.1 
 
 		 529 aa  74.3  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>