98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0598 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 
501 aa  1033    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  86.75 
 
 
499 aa  909    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  44.78 
 
 
502 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.14 
 
 
501 aa  442  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.67 
 
 
510 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  45.62 
 
 
507 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.05 
 
 
548 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  45.25 
 
 
505 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.35 
 
 
503 aa  432  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.09 
 
 
502 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.89 
 
 
502 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.64 
 
 
505 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.35 
 
 
506 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.32 
 
 
504 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  44.76 
 
 
507 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.72 
 
 
501 aa  424  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.34 
 
 
514 aa  424  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.42 
 
 
502 aa  420  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  42.68 
 
 
502 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  43.3 
 
 
506 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.64 
 
 
504 aa  415  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.37 
 
 
507 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.31 
 
 
500 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.65 
 
 
508 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.85 
 
 
499 aa  402  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  49.52 
 
 
448 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.49 
 
 
507 aa  396  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  46.81 
 
 
525 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.2 
 
 
502 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  46.55 
 
 
527 aa  391  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  40.85 
 
 
501 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.31 
 
 
512 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.25 
 
 
511 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.72 
 
 
503 aa  376  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  40.43 
 
 
522 aa  372  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.36 
 
 
515 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  39.68 
 
 
515 aa  364  2e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  36.1 
 
 
566 aa  352  7e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  39.79 
 
 
504 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.73 
 
 
484 aa  333  3e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.98 
 
 
484 aa  333  6e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  37.06 
 
 
543 aa  300  3e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.55 
 
 
511 aa  290  6e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.67 
 
 
534 aa  266  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.93 
 
 
493 aa  229  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  35.21 
 
 
501 aa  228  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.44 
 
 
662 aa  222  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.8 
 
 
505 aa  217  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.98 
 
 
492 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.43 
 
 
526 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.41 
 
 
514 aa  212  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.45 
 
 
521 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.16 
 
 
549 aa  202  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.06 
 
 
512 aa  200  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.33 
 
 
510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.62 
 
 
509 aa  196  6e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.4 
 
 
513 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.42 
 
 
503 aa  193  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  29.74 
 
 
505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.29 
 
 
529 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.92 
 
 
535 aa  183  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.77 
 
 
506 aa  183  8.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  29.54 
 
 
552 aa  182  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  27.59 
 
 
534 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.91 
 
 
526 aa  179  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  30.06 
 
 
551 aa  179  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.36 
 
 
507 aa  178  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  40.61 
 
 
732 aa  170  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.31 
 
 
525 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.48 
 
 
515 aa  158  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.22 
 
 
551 aa  158  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.87 
 
 
778 aa  153  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.39 
 
 
703 aa  148  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.24 
 
 
508 aa  146  7.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.43 
 
 
691 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.78 
 
 
772 aa  131  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25.81 
 
 
704 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25.61 
 
 
704 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.61 
 
 
684 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  24.83 
 
 
699 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  23.61 
 
 
679 aa  84  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  30.43 
 
 
821 aa  77.8  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.67 
 
 
634 aa  77.4  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.67 
 
 
644 aa  77.4  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25.51 
 
 
483 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.87 
 
 
663 aa  73.6  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  23.35 
 
 
855 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.2 
 
 
824 aa  68.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25.12 
 
 
818 aa  64.3  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.5 
 
 
826 aa  62  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1789  putative alpha-L-arabinofuranosidase  28.33 
 
 
550 aa  60.8  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0379328  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.11 
 
 
959 aa  60.5  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.42 
 
 
661 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.83 
 
 
660 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6365  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  26.42 
 
 
579 aa  53.5  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15975  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0895  alpha-L-arabinofuranosidase  22.19 
 
 
732 aa  52.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  27.24 
 
 
727 aa  50.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  26.09 
 
 
719 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>