97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3612 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 
521 aa  1075    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  59.84 
 
 
526 aa  644    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  57.54 
 
 
505 aa  630  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  54.29 
 
 
492 aa  592  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  56.56 
 
 
505 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  52.82 
 
 
534 aa  578  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  53.27 
 
 
513 aa  561  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  51.81 
 
 
512 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  50 
 
 
514 aa  532  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.36 
 
 
509 aa  521  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.6 
 
 
529 aa  518  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.93 
 
 
525 aa  512  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  48.67 
 
 
526 aa  508  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  49.36 
 
 
551 aa  507  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  51.59 
 
 
552 aa  504  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.29 
 
 
507 aa  500  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.7 
 
 
515 aa  495  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.92 
 
 
510 aa  492  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.4 
 
 
506 aa  493  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.9 
 
 
535 aa  472  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  36.87 
 
 
551 aa  345  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.58 
 
 
503 aa  323  3e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  36 
 
 
501 aa  318  2e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  33.6 
 
 
508 aa  280  3e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.33 
 
 
484 aa  247  4e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.33 
 
 
484 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  30.67 
 
 
504 aa  211  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.45 
 
 
501 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.83 
 
 
548 aa  198  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.4 
 
 
502 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.53 
 
 
501 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.46 
 
 
499 aa  190  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.72 
 
 
493 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.27 
 
 
502 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.4 
 
 
507 aa  187  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.83 
 
 
534 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.8 
 
 
502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.09 
 
 
501 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.77 
 
 
506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.05 
 
 
514 aa  184  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.4 
 
 
505 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.49 
 
 
510 aa  181  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  27.65 
 
 
507 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  27.44 
 
 
525 aa  178  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  26.95 
 
 
543 aa  177  3e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  27.14 
 
 
566 aa  177  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.4 
 
 
502 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  29.5 
 
 
505 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.1 
 
 
512 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.49 
 
 
499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.49 
 
 
504 aa  174  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.79 
 
 
502 aa  174  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.05 
 
 
503 aa  172  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.63 
 
 
501 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.31 
 
 
507 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  31.06 
 
 
527 aa  167  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.42 
 
 
508 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.91 
 
 
511 aa  163  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.76 
 
 
515 aa  162  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  27 
 
 
522 aa  162  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.19 
 
 
549 aa  161  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  26.85 
 
 
506 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.37 
 
 
502 aa  160  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  30.26 
 
 
448 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.63 
 
 
504 aa  158  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.46 
 
 
500 aa  156  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  26.93 
 
 
515 aa  155  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.99 
 
 
503 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.01 
 
 
507 aa  153  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.27 
 
 
511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.38 
 
 
662 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.69 
 
 
778 aa  135  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.4 
 
 
691 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  34.04 
 
 
732 aa  117  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.57 
 
 
684 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.56 
 
 
703 aa  113  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.55 
 
 
772 aa  93.6  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  24.02 
 
 
660 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.59 
 
 
704 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  26.4 
 
 
704 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.95 
 
 
661 aa  85.9  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  24.72 
 
 
679 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  20.42 
 
 
634 aa  73.9  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  20.42 
 
 
644 aa  73.6  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.66 
 
 
663 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.11 
 
 
826 aa  68.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  24.84 
 
 
699 aa  67  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  28.89 
 
 
821 aa  60.8  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  35.96 
 
 
959 aa  60.5  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  31.86 
 
 
818 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.95 
 
 
855 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0895  alpha-L-arabinofuranosidase  21.88 
 
 
732 aa  55.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.2 
 
 
824 aa  54.3  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  30.52 
 
 
719 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.35 
 
 
483 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1789  putative alpha-L-arabinofuranosidase  28.57 
 
 
550 aa  45.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0379328  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3247  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.73 
 
 
388 aa  43.9  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>