75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1789 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1789  putative alpha-L-arabinofuranosidase  100 
 
 		 550 aa  1130    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0379328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.6 
 
 		 503 aa  82  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  27.42 
 
 		 505 aa  78.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.31 
 
 		 514 aa  76.6  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  30.39 
 
 		 506 aa  76.6  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.07 
 
 		 503 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.1 
 
 		 504 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  28.57 
 
 		 704 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.43 
 
 		 506 aa  75.5  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.45 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.77 
 
 		 505 aa  73.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.07 
 
 		 507 aa  73.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.45 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  30.94 
 
 		 525 aa  72.8  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  31.87 
 
 		 502 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.48 
 
 		 512 aa  72  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  27.55 
 
 		 704 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.94 
 
 		 510 aa  71.6  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.03 
 
 		 548 aa  70.5  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  29.21 
 
 		 543 aa  70.1  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.02 
 
 		 502 aa  68.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.93 
 
 		 502 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.9 
 
 		 501 aa  68.6  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.56 
 
 		 504 aa  68.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.76 
 
 		 499 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.18 
 
 		 502 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.38 
 
 		 501 aa  66.6  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  28.18 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  28.8 
 
 		 504 aa  65.1  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.22 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  27.03 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.11 
 
 		 499 aa  64.3  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.63 
 
 		 662 aa  63.5  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  28.42 
 
 		 522 aa  63.5  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.24 
 
 		 732 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.93 
 
 		 502 aa  63.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.89 
 
 		 502 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.83 
 
 		 500 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.42 
 
 		 511 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.12 
 
 		 703 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.49 
 
 		 515 aa  62  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.44 
 
 		 549 aa  61.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.1 
 
 		 684 aa  61.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.98 
 
 		 508 aa  60.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.33 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  31.32 
 
 		 527 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  28.21 
 
 		 679 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.09 
 
 		 508 aa  59.3  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  21.48 
 
 		 503 aa  59.3  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  28.81 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  26.67 
 
 		 566 aa  57.4  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.8 
 
 		 501 aa  56.2  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  25 
 
 		 507 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.9 
 
 		 691 aa  53.9  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  31.17 
 
 		 534 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  23.15 
 
 		 699 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  22.54 
 
 		 772 aa  52  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.35 
 
 		 529 aa  51.2  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.03 
 
 		 507 aa  49.7  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  24.77 
 
 		 507 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2071  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.35 
 
 		 535 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.85 
 
 		 512 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.44 
 
 		 526 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.67 
 
 		 515 aa  48.9  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.88 
 
 		 511 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.14 
 
 		 525 aa  48.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.38 
 
 		 535 aa  46.6  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.6 
 
 		 506 aa  47  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.63 
 
 		 513 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.17 
 
 		 959 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.57 
 
 		 521 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.33 
 
 		 493 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.45 
 
 		 509 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  25 
 
 		 551 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  29.11 
 
 		 505 aa  44.3  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>