95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3590 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  63.04 
 
 		 507 aa  640    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 507 aa  1040    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  60.71 
 
 		 501 aa  612  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  59.56 
 
 		 500 aa  607  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  59.64 
 
 		 506 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  60.52 
 
 		 525 aa  599  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  60.12 
 
 		 515 aa  593  1e-168  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  59.24 
 
 		 504 aa  593  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  58.12 
 
 		 522 aa  566  1e-160  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  56.8 
 
 		 511 aa  565  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.18 
 
 		 504 aa  561  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.6 
 
 		 507 aa  558  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.77 
 
 		 503 aa  548  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.2 
 
 		 515 aa  548  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  53.28 
 
 		 505 aa  547  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  49.21 
 
 		 502 aa  522  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  51.49 
 
 		 502 aa  523  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.27 
 
 		 508 aa  518  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.52 
 
 		 503 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  59.72 
 
 		 448 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.19 
 
 		 501 aa  511  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.6 
 
 		 510 aa  509  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  53.08 
 
 		 527 aa  506  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.3 
 
 		 499 aa  502  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.2 
 
 		 506 aa  504  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  49.62 
 
 		 566 aa  499  1e-140  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.18 
 
 		 512 aa  489  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.05 
 
 		 505 aa  487  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  47.7 
 
 		 507 aa  481  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.91 
 
 		 502 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.72 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.31 
 
 		 502 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.8 
 
 		 502 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.94 
 
 		 502 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  40.99 
 
 		 501 aa  422  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.37 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.71 
 
 		 499 aa  408  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.72 
 
 		 548 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.85 
 
 		 484 aa  261  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.85 
 
 		 484 aa  261  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  34.85 
 
 		 504 aa  233  7.000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  31.7 
 
 		 543 aa  213  5.999999999999999e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.58 
 
 		 511 aa  204  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  30 
 
 		 503 aa  197  5.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.35 
 
 		 501 aa  196  6e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.12 
 
 		 493 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.88 
 
 		 549 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.3 
 
 		 534 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.29 
 
 		 526 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.13 
 
 		 513 aa  173  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.56 
 
 		 514 aa  169  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.31 
 
 		 521 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.22 
 
 		 732 aa  167  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  28.35 
 
 		 551 aa  163  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.15 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.16 
 
 		 662 aa  160  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.04 
 
 		 506 aa  160  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.7 
 
 		 526 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  28.28 
 
 		 505 aa  159  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.57 
 
 		 512 aa  158  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.65 
 
 		 510 aa  157  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  28.3 
 
 		 552 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.39 
 
 		 505 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  26.88 
 
 		 534 aa  152  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.38 
 
 		 535 aa  150  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.24 
 
 		 515 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.16 
 
 		 507 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.57 
 
 		 551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.53 
 
 		 508 aa  137  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.68 
 
 		 509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.42 
 
 		 703 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.86 
 
 		 525 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.48 
 
 		 529 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.27 
 
 		 778 aa  123  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.41 
 
 		 691 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  24.85 
 
 		 772 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  22.99 
 
 		 704 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.82 
 
 		 704 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.2 
 
 		 684 aa  67.4  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.48 
 
 		 644 aa  61.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.48 
 
 		 634 aa  61.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.45 
 
 		 824 aa  60.8  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  21.72 
 
 		 679 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1789  putative alpha-L-arabinofuranosidase  25 
 
 		 550 aa  55.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0379328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.93 
 
 		 826 aa  54.7  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.75 
 
 		 663 aa  53.5  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.32 
 
 		 855 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.73 
 
 		 660 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.88 
 
 		 661 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  24.64 
 
 		 699 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  26.46 
 
 		 483 aa  47  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6365  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  21.94 
 
 		 579 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  23.87 
 
 		 821 aa  44.7  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0895  alpha-L-arabinofuranosidase  27.44 
 
 		 732 aa  44.7  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  27.27 
 
 		 1141 aa  43.9  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>