90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1036 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  100 
 
 
501 aa  1040    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  53.83 
 
 
502 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.8 
 
 
505 aa  553  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  52.59 
 
 
502 aa  547  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.8 
 
 
510 aa  532  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.09 
 
 
501 aa  526  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.04 
 
 
514 aa  520  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.31 
 
 
503 aa  513  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.48 
 
 
499 aa  482  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.69 
 
 
502 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.53 
 
 
504 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.69 
 
 
502 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  43.71 
 
 
505 aa  468  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  43 
 
 
502 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.17 
 
 
506 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  43.03 
 
 
507 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  40.71 
 
 
507 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.86 
 
 
511 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.45 
 
 
515 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  41.92 
 
 
525 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.4 
 
 
504 aa  434  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  39.32 
 
 
506 aa  426  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.03 
 
 
501 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.85 
 
 
500 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.55 
 
 
503 aa  419  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.99 
 
 
507 aa  422  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  40 
 
 
502 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.17 
 
 
507 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  40.43 
 
 
522 aa  402  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.48 
 
 
508 aa  401  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  40.75 
 
 
515 aa  395  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  43.4 
 
 
448 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.85 
 
 
501 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.92 
 
 
499 aa  386  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.29 
 
 
512 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  40.83 
 
 
527 aa  368  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.4 
 
 
548 aa  360  5e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  35.89 
 
 
566 aa  352  1e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  35.17 
 
 
504 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.32 
 
 
484 aa  279  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.52 
 
 
484 aa  278  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.97 
 
 
511 aa  253  7e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.03 
 
 
534 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  32.51 
 
 
543 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.38 
 
 
501 aa  186  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.67 
 
 
492 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.77 
 
 
493 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.63 
 
 
521 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.24 
 
 
514 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.19 
 
 
507 aa  170  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.19 
 
 
513 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.75 
 
 
503 aa  164  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.7 
 
 
526 aa  163  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.01 
 
 
512 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  25.3 
 
 
505 aa  157  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  27.13 
 
 
552 aa  156  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.82 
 
 
549 aa  156  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  27.5 
 
 
551 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.3 
 
 
535 aa  154  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.31 
 
 
506 aa  152  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  26.46 
 
 
534 aa  152  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.62 
 
 
509 aa  150  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.1 
 
 
662 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.88 
 
 
529 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  24.45 
 
 
505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.81 
 
 
526 aa  141  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.1 
 
 
515 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.33 
 
 
510 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.51 
 
 
525 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.36 
 
 
732 aa  133  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.16 
 
 
551 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.19 
 
 
508 aa  119  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.81 
 
 
691 aa  118  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.1 
 
 
772 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.41 
 
 
778 aa  100  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.76 
 
 
703 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  22.2 
 
 
704 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.96 
 
 
684 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1789  putative alpha-L-arabinofuranosidase  30.22 
 
 
550 aa  65.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0379328  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  20.37 
 
 
704 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1170  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  32.48 
 
 
693 aa  53.5  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000394833  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  20.67 
 
 
679 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.1 
 
 
634 aa  51.2  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.1 
 
 
644 aa  50.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.48 
 
 
824 aa  50.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.68 
 
 
826 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  25.6 
 
 
821 aa  48.5  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.56 
 
 
663 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.41 
 
 
818 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  20.31 
 
 
661 aa  43.9  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>