95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3528 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  73.52 
 
 
510 aa  764    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  74.41 
 
 
507 aa  789    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  64.64 
 
 
535 aa  658    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  69.49 
 
 
506 aa  729    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  63.98 
 
 
515 aa  653    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  70.63 
 
 
551 aa  731    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  72.48 
 
 
552 aa  751    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 
509 aa  1050    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  53.95 
 
 
505 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.77 
 
 
526 aa  564  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  51.29 
 
 
492 aa  559  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  49 
 
 
514 aa  522  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  49.29 
 
 
513 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.36 
 
 
521 aa  521  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  50.1 
 
 
505 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  50.2 
 
 
512 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.49 
 
 
525 aa  498  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  46.99 
 
 
534 aa  478  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.77 
 
 
529 aa  443  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  41.54 
 
 
526 aa  402  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.2 
 
 
503 aa  350  4e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  37.14 
 
 
551 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  40.77 
 
 
501 aa  310  5.9999999999999995e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  33.14 
 
 
508 aa  281  2e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.22 
 
 
484 aa  262  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.01 
 
 
484 aa  261  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  32.01 
 
 
504 aa  211  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.62 
 
 
501 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.19 
 
 
548 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.69 
 
 
499 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  33.83 
 
 
543 aa  177  3e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.3 
 
 
534 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.65 
 
 
493 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.09 
 
 
514 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.52 
 
 
507 aa  165  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.9 
 
 
502 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.38 
 
 
502 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.62 
 
 
504 aa  164  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.04 
 
 
501 aa  163  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.88 
 
 
549 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.61 
 
 
512 aa  160  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  26.76 
 
 
507 aa  159  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.2 
 
 
502 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  28.19 
 
 
505 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  29.38 
 
 
525 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.69 
 
 
502 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  27.64 
 
 
506 aa  153  8.999999999999999e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.1 
 
 
511 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.22 
 
 
502 aa  152  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.62 
 
 
501 aa  150  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.79 
 
 
501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.43 
 
 
504 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.95 
 
 
506 aa  147  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.43 
 
 
510 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.68 
 
 
508 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.45 
 
 
503 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  30 
 
 
448 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.55 
 
 
503 aa  143  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.76 
 
 
500 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.67 
 
 
505 aa  140  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.29 
 
 
507 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.65 
 
 
511 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.26 
 
 
515 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.11 
 
 
778 aa  139  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.48 
 
 
502 aa  137  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.58 
 
 
499 aa  137  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  26.27 
 
 
566 aa  137  5e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  26.85 
 
 
515 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.68 
 
 
507 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  28.94 
 
 
522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.34 
 
 
662 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  28.9 
 
 
527 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.93 
 
 
684 aa  127  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.58 
 
 
691 aa  127  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.13 
 
 
703 aa  127  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  48 
 
 
732 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  38.81 
 
 
772 aa  95.1  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.17 
 
 
634 aa  73.2  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.17 
 
 
644 aa  73.2  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  22.84 
 
 
704 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.01 
 
 
824 aa  70.5  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.72 
 
 
704 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.38 
 
 
661 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  31.17 
 
 
821 aa  62.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.04 
 
 
660 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0895  alpha-L-arabinofuranosidase  29.27 
 
 
732 aa  61.2  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.57 
 
 
663 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  30.92 
 
 
679 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.62 
 
 
855 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  29.93 
 
 
699 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.28 
 
 
826 aa  50.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  29.21 
 
 
959 aa  48.5  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1789  putative alpha-L-arabinofuranosidase  25.45 
 
 
550 aa  45.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0379328  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  28.07 
 
 
818 aa  44.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  28.12 
 
 
719 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>