91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29290 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  78.79 
 
 		 552 aa  872    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  100 
 
 		 551 aa  1128    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  68.79 
 
 		 506 aa  729    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  62.91 
 
 		 535 aa  640    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  61.9 
 
 		 515 aa  634    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  74.75 
 
 		 507 aa  779    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  69.03 
 
 		 510 aa  715    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  70.63 
 
 		 509 aa  731    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  56.02 
 
 		 505 aa  588  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  52.28 
 
 		 492 aa  546  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.48 
 
 		 526 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.01 
 
 		 514 aa  516  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  50.1 
 
 		 505 aa  509  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.36 
 
 		 521 aa  507  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  48.73 
 
 		 513 aa  500  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  48.37 
 
 		 512 aa  487  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  47.75 
 
 		 534 aa  482  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.8 
 
 		 525 aa  478  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.12 
 
 		 529 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  42.11 
 
 		 526 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.57 
 
 		 503 aa  349  8e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  36.69 
 
 		 551 aa  325  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  40.31 
 
 		 501 aa  312  7.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  32.26 
 
 		 508 aa  270  4e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.82 
 
 		 484 aa  252  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.63 
 
 		 484 aa  250  4e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.24 
 
 		 548 aa  192  9e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.28 
 
 		 514 aa  189  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.06 
 
 		 499 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  29.89 
 
 		 504 aa  183  8.000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.14 
 
 		 508 aa  180  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  30.55 
 
 		 505 aa  180  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.06 
 
 		 501 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.53 
 
 		 534 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.36 
 
 		 504 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.5 
 
 		 502 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.76 
 
 		 510 aa  171  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.36 
 
 		 500 aa  171  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  32.14 
 
 		 507 aa  171  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.48 
 
 		 493 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  28.6 
 
 		 543 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.38 
 
 		 503 aa  167  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.68 
 
 		 506 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.94 
 
 		 502 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  29.53 
 
 		 525 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  28.49 
 
 		 507 aa  163  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.35 
 
 		 507 aa  163  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  29.46 
 
 		 566 aa  163  7e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.81 
 
 		 512 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.36 
 
 		 511 aa  161  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.42 
 
 		 507 aa  159  9e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.77 
 
 		 501 aa  159  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.14 
 
 		 505 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  28.33 
 
 		 522 aa  158  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.62 
 
 		 504 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.5 
 
 		 501 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.57 
 
 		 499 aa  156  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.5 
 
 		 549 aa  154  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  29.13 
 
 		 506 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.98 
 
 		 501 aa  151  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.01 
 
 		 503 aa  150  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.19 
 
 		 502 aa  150  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  27.53 
 
 		 515 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  30.37 
 
 		 448 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.74 
 
 		 502 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.51 
 
 		 502 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.51 
 
 		 502 aa  143  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.58 
 
 		 511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  29.13 
 
 		 527 aa  140  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.72 
 
 		 515 aa  137  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.99 
 
 		 778 aa  131  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.62 
 
 		 662 aa  131  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  44.8 
 
 		 732 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.67 
 
 		 684 aa  110  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.38 
 
 		 703 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.11 
 
 		 691 aa  99.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  37.31 
 
 		 772 aa  91.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.32 
 
 		 704 aa  77  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.87 
 
 		 634 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.87 
 
 		 644 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.13 
 
 		 824 aa  64.7  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.81 
 
 		 661 aa  62.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  23.53 
 
 		 660 aa  61.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  30.69 
 
 		 704 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  23.19 
 
 		 679 aa  57.4  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0895  alpha-L-arabinofuranosidase  22.61 
 
 		 732 aa  55.5  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  31.58 
 
 		 821 aa  53.5  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.62 
 
 		 663 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.42 
 
 		 826 aa  47.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  27.01 
 
 		 818 aa  47.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  24.6 
 
 		 699 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>