91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5739 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  100 
 
 		 855 aa  1782    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.26 
 
 		 663 aa  588  1e-166  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  42.66 
 
 		 821 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.06 
 
 		 661 aa  449  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.35 
 
 		 824 aa  422  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.96 
 
 		 826 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  37.73 
 
 		 660 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.04 
 
 		 644 aa  412  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.04 
 
 		 634 aa  412  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0895  alpha-L-arabinofuranosidase  29.64 
 
 		 732 aa  252  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02541  alpha-arabinofuranosidase (Eurofung)  29.47 
 
 		 565 aa  164  7e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.8 
 
 		 691 aa  137  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.48 
 
 		 703 aa  126  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.35 
 
 		 684 aa  121  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.44 
 
 		 662 aa  98.6  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.24 
 
 		 529 aa  83.2  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.15 
 
 		 499 aa  79  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  31.06 
 
 		 501 aa  77.8  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.11 
 
 		 484 aa  77  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.9 
 
 		 484 aa  75.5  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1805  hypothetical protein  33.95 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.67 
 
 		 732 aa  73.9  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.17 
 
 		 526 aa  72.8  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.71 
 
 		 501 aa  72.4  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.97 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.71 
 
 		 778 aa  70.5  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.95 
 
 		 501 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4087  hypothetical protein  31.28 
 
 		 305 aa  70.1  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2119  hypothetical protein  32.5 
 
 		 304 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.27 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.49 
 
 		 511 aa  69.3  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.77 
 
 		 505 aa  69.3  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2785  hypothetical protein  30 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0402448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  23.46 
 
 		 772 aa  68.2  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.87 
 
 		 534 aa  67.8  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  26.58 
 
 		 534 aa  67  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.49 
 
 		 492 aa  66.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  29.22 
 
 		 525 aa  65.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1139 aa  66.2  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.39 
 
 		 513 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.97 
 
 		 515 aa  64.7  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.03 
 
 		 512 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  29.22 
 
 		 527 aa  64.3  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  29.52 
 
 		 543 aa  64.3  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.57 
 
 		 504 aa  63.9  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.12 
 
 		 503 aa  63.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  19.39 
 
 		 507 aa  63.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  27.27 
 
 		 504 aa  62.4  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.39 
 
 		 503 aa  62.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.22 
 
 		 526 aa  62.4  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  26.62 
 
 		 566 aa  62  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  22.92 
 
 		 506 aa  60.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  27.92 
 
 		 522 aa  58.5  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  27.92 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.57 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  24.84 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.57 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.38 
 
 		 551 aa  57.8  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.8 
 
 		 493 aa  57.4  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.27 
 
 		 515 aa  57.4  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.97 
 
 		 508 aa  57.4  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4606  glycoside hydrolase family 43  29.73 
 
 		 675 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.22 
 
 		 507 aa  57  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.3 
 
 		 521 aa  56.2  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.1 
 
 		 549 aa  55.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.27 
 
 		 507 aa  55.1  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.62 
 
 		 507 aa  55.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.97 
 
 		 506 aa  53.5  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.16 
 
 		 502 aa  53.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.58 
 
 		 535 aa  53.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.85 
 
 		 510 aa  53.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.97 
 
 		 511 aa  52.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.45 
 
 		 525 aa  52.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  26.62 
 
 		 448 aa  52.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.27 
 
 		 504 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.42 
 
 		 503 aa  51.6  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  25.32 
 
 		 505 aa  51.2  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.97 
 
 		 502 aa  51.2  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.32 
 
 		 502 aa  51.2  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.22 
 
 		 506 aa  50.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.32 
 
 		 548 aa  50.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.84 
 
 		 514 aa  49.3  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.84 
 
 		 499 aa  48.9  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  27.22 
 
 		 551 aa  48.1  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.27 
 
 		 500 aa  48.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.38 
 
 		 501 aa  47.8  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3471  hypothetical protein  24.68 
 
 		 274 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  25.97 
 
 		 552 aa  46.2  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.73 
 
 		 502 aa  45.8  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  25.97 
 
 		 505 aa  46.2  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.28 
 
 		 508 aa  44.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>