42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4606 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4606  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 675 aa  1407    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4320  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  56.51 
 
 		 330 aa  342  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327535  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2119  hypothetical protein  32.28 
 
 		 304 aa  142  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3471  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4087  hypothetical protein  31 
 
 		 305 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2785  hypothetical protein  31.05 
 
 		 311 aa  130  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0402448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1805  hypothetical protein  31.18 
 
 		 300 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1139 aa  123  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3438  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.11 
 
 		 316 aa  110  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0527524  normal  0.0695696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2702  hypothetical protein  27.21 
 
 		 348 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000025037  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  31.11 
 
 		 739 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  31.1 
 
 		 982 aa  106  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2023  hypothetical protein  27.48 
 
 		 342 aa  94.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131758  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  26.65 
 
 		 644 aa  92  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36540  hypothetical protein  25.57 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2076  hypothetical protein  28.47 
 
 		 314 aa  83.2  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1971  alpha-L-arabinofuranosidase B  25.33 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000055654  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01090  Ig-like domain-containing protein  26.36 
 
 		 583 aa  71.2  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0816  endo-1,4-beta-xylanase  23.6 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  27.13 
 
 		 296 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  27.13 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01100  hypothetical protein  26.21 
 
 		 992 aa  57.4  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14440  hypothetical protein  25.87 
 
 		 323 aa  57  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.73 
 
 		 855 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  21.98 
 
 		 328 aa  55.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  26.38 
 
 		 328 aa  53.5  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  31.4 
 
 		 561 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  23.83 
 
 		 319 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  25.41 
 
 		 456 aa  52.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3223  putative beta-xylosidase  24.37 
 
 		 377 aa  51.6  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222849  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  24.02 
 
 		 345 aa  47.8  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2260  hypothetical protein  29.05 
 
 		 319 aa  47.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46285  normal  0.598138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  23.36 
 
 		 304 aa  47.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  22.57 
 
 		 325 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15480  hypothetical protein  31.82 
 
 		 508 aa  45.8  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.857136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7019  alpha-L-arabinofuranosidase B  24.07 
 
 		 455 aa  44.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  29.95 
 
 		 384 aa  44.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  29.41 
 
 		 323 aa  44.7  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  22.84 
 
 		 524 aa  44.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1511  surface protein  32.61 
 
 		 1065 aa  44.3  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.36671  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1379  Beta-fructofuranosidase  30.81 
 
 		 432 aa  43.9  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1307  Beta-fructofuranosidase  30.81 
 
 		 432 aa  43.9  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>