28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2119 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2119  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  632  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4087  hypothetical protein  61.36 
 
 		 305 aa  399  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2785  hypothetical protein  60.2 
 
 		 311 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0402448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1805  hypothetical protein  61.07 
 
 		 300 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  43.51 
 
 		 1139 aa  269  5e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4606  glycoside hydrolase family 43  32.28 
 
 		 675 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3471  hypothetical protein  32.2 
 
 		 274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  33.22 
 
 		 982 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  29.61 
 
 		 739 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2076  hypothetical protein  27.53 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3438  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.04 
 
 		 316 aa  99.8  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0527524  normal  0.0695696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2023  hypothetical protein  26.61 
 
 		 342 aa  99.8  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131758  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2702  hypothetical protein  27.6 
 
 		 348 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000025037  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36540  hypothetical protein  28.16 
 
 		 324 aa  95.5  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0816  endo-1,4-beta-xylanase  26.53 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  26.3 
 
 		 644 aa  79.3  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14440  hypothetical protein  33.12 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01090  Ig-like domain-containing protein  29.38 
 
 		 583 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1971  alpha-L-arabinofuranosidase B  26.48 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000055654  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  32.5 
 
 		 855 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7019  alpha-L-arabinofuranosidase B  27.59 
 
 		 455 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02590  hypothetical protein  23.26 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07781  arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00650)  26.16 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.621545 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3223  putative beta-xylosidase  24.46 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222849  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7065  alpha-L-arabinofuranosidase B  26.34 
 
 		 445 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0253597  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08472  conserved hypothetical protein  20.9 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.327023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01100  hypothetical protein  27.08 
 
 		 992 aa  49.7  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1511  surface protein  28.3 
 
 		 1065 aa  49.7  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.36671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>