96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1118 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  63.3 
 
 
513 aa  692    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 
514 aa  1069    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  57.72 
 
 
512 aa  614  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  55.42 
 
 
505 aa  588  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  55.19 
 
 
492 aa  588  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.29 
 
 
526 aa  577  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  50 
 
 
521 aa  532  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.9 
 
 
507 aa  533  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  49 
 
 
509 aa  522  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.04 
 
 
525 aa  520  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.5 
 
 
510 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  49.01 
 
 
551 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.59 
 
 
506 aa  509  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.19 
 
 
535 aa  510  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.49 
 
 
515 aa  508  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  48.2 
 
 
552 aa  509  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  45.59 
 
 
505 aa  496  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  49.28 
 
 
534 aa  491  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.4 
 
 
529 aa  465  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  43.46 
 
 
526 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.86 
 
 
503 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  37.79 
 
 
551 aa  357  3.9999999999999996e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  39.15 
 
 
501 aa  346  7e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  33.2 
 
 
508 aa  278  2e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.55 
 
 
484 aa  273  6e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.8 
 
 
484 aa  271  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  31.39 
 
 
504 aa  216  7e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.41 
 
 
501 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.81 
 
 
548 aa  209  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.7 
 
 
507 aa  203  5e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.23 
 
 
504 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.83 
 
 
499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.49 
 
 
502 aa  196  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.83 
 
 
534 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  28.17 
 
 
505 aa  193  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  29.47 
 
 
543 aa  191  4e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.41 
 
 
514 aa  186  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.39 
 
 
502 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.71 
 
 
504 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  26.81 
 
 
525 aa  183  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  28.23 
 
 
507 aa  183  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.28 
 
 
501 aa  182  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.44 
 
 
499 aa  182  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.38 
 
 
502 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.29 
 
 
502 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.64 
 
 
501 aa  176  8e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.4 
 
 
493 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  28.32 
 
 
566 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.98 
 
 
503 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.21 
 
 
506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.43 
 
 
505 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.66 
 
 
502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.43 
 
 
510 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.24 
 
 
501 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.75 
 
 
503 aa  170  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.56 
 
 
507 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  26.18 
 
 
506 aa  169  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  27.04 
 
 
515 aa  169  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  26.46 
 
 
522 aa  168  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  29.41 
 
 
527 aa  166  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.29 
 
 
511 aa  166  9e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.85 
 
 
508 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  27.93 
 
 
448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.02 
 
 
500 aa  163  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.62 
 
 
512 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.72 
 
 
515 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  24.51 
 
 
507 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.1 
 
 
502 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.46 
 
 
549 aa  149  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.62 
 
 
778 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.18 
 
 
662 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.55 
 
 
511 aa  140  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  40 
 
 
732 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.69 
 
 
703 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.5 
 
 
684 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.81 
 
 
661 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  38.06 
 
 
772 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.96 
 
 
691 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  22.39 
 
 
660 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.51 
 
 
824 aa  89.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.71 
 
 
644 aa  86.3  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.42 
 
 
634 aa  86.3  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.14 
 
 
663 aa  75.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  20.24 
 
 
704 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.89 
 
 
826 aa  70.5  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.03 
 
 
855 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  32.82 
 
 
679 aa  67.8  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  20.77 
 
 
704 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  25.33 
 
 
821 aa  65.5  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  31.97 
 
 
699 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0895  alpha-L-arabinofuranosidase  20.51 
 
 
732 aa  57.4  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  30.97 
 
 
818 aa  54.7  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  27.78 
 
 
959 aa  53.9  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  26.28 
 
 
483 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  32.52 
 
 
719 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02541  alpha-arabinofuranosidase (Eurofung)  27.22 
 
 
565 aa  44.3  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>