97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0924 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  100 
 
 
566 aa  1177    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  52.26 
 
 
506 aa  511  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.62 
 
 
507 aa  499  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.17 
 
 
501 aa  496  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  51.57 
 
 
507 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  51.66 
 
 
522 aa  492  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  48.35 
 
 
525 aa  489  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.71 
 
 
504 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.9 
 
 
507 aa  486  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.72 
 
 
501 aa  487  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  51.06 
 
 
515 aa  486  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.53 
 
 
500 aa  477  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.56 
 
 
515 aa  475  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.46 
 
 
511 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  45.56 
 
 
502 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.21 
 
 
510 aa  462  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.74 
 
 
503 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  46.73 
 
 
505 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.62 
 
 
499 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.37 
 
 
508 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.51 
 
 
504 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  46.47 
 
 
527 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  44.27 
 
 
507 aa  448  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.23 
 
 
503 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  44.1 
 
 
502 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.05 
 
 
502 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.45 
 
 
505 aa  436  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.85 
 
 
502 aa  435  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.98 
 
 
506 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  50.12 
 
 
448 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.27 
 
 
514 aa  423  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.66 
 
 
502 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.41 
 
 
502 aa  421  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.71 
 
 
512 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.1 
 
 
501 aa  352  8e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  35.89 
 
 
501 aa  352  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.84 
 
 
548 aa  347  4e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.99 
 
 
499 aa  343  4e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  34.92 
 
 
504 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.77 
 
 
484 aa  250  5e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.77 
 
 
484 aa  250  6e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  33.98 
 
 
543 aa  229  1e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.45 
 
 
511 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.36 
 
 
501 aa  201  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.07 
 
 
503 aa  195  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.28 
 
 
526 aa  191  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.76 
 
 
534 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.86 
 
 
493 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.14 
 
 
521 aa  177  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.32 
 
 
514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.55 
 
 
549 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.75 
 
 
513 aa  174  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  27.31 
 
 
534 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  29.46 
 
 
551 aa  163  8.000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.65 
 
 
492 aa  162  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.49 
 
 
662 aa  161  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.94 
 
 
505 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.35 
 
 
529 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  25.63 
 
 
505 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.09 
 
 
732 aa  152  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.83 
 
 
512 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.06 
 
 
526 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.81 
 
 
506 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  28.11 
 
 
552 aa  145  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.59 
 
 
507 aa  144  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.52 
 
 
508 aa  141  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.59 
 
 
510 aa  140  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.78 
 
 
551 aa  140  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.52 
 
 
515 aa  139  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.27 
 
 
509 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.73 
 
 
778 aa  135  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.49 
 
 
535 aa  128  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.14 
 
 
525 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.73 
 
 
691 aa  127  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  24.94 
 
 
772 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.82 
 
 
703 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.98 
 
 
684 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  25.67 
 
 
679 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.82 
 
 
704 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.62 
 
 
704 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.26 
 
 
663 aa  65.1  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.2 
 
 
634 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.2 
 
 
644 aa  62  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.93 
 
 
826 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.32 
 
 
855 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1789  putative alpha-L-arabinofuranosidase  26.67 
 
 
550 aa  57.4  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0379328  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.33 
 
 
660 aa  57  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.28 
 
 
824 aa  55.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  25 
 
 
821 aa  53.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6365  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.57 
 
 
579 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15975  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2382  hypothetical protein  31.46 
 
 
1002 aa  50.8  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2071  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.89 
 
 
535 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1170  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  27.35 
 
 
693 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000394833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  23.56 
 
 
699 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.42 
 
 
661 aa  47.8  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  22.91 
 
 
959 aa  44.7  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  26.01 
 
 
727 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>