47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1170 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1170  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  100 
 
 
693 aa  1414    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000394833  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2071  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  38.79 
 
 
535 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25.65 
 
 
818 aa  142  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25.96 
 
 
959 aa  75.5  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  27.3 
 
 
727 aa  68.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.56 
 
 
484 aa  66.6  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.19 
 
 
484 aa  65.1  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.84 
 
 
514 aa  61.2  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  26.32 
 
 
679 aa  61.2  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  33.93 
 
 
772 aa  59.3  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.69 
 
 
691 aa  58.9  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  26.29 
 
 
699 aa  57.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  30.59 
 
 
527 aa  57.8  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  33.97 
 
 
502 aa  57  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  36.94 
 
 
502 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  36.04 
 
 
505 aa  55.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  28.57 
 
 
525 aa  55.1  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  32.48 
 
 
501 aa  53.5  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6365  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.41 
 
 
579 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15975  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25.62 
 
 
483 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.48 
 
 
507 aa  53.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  35.16 
 
 
732 aa  52  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  25 
 
 
506 aa  52  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.05 
 
 
499 aa  51.6  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.93 
 
 
501 aa  51.6  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.82 
 
 
502 aa  51.2  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.39 
 
 
510 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.86 
 
 
501 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  27.35 
 
 
566 aa  48.9  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  21.37 
 
 
502 aa  48.9  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.54 
 
 
493 aa  48.5  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.7 
 
 
505 aa  48.5  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.94 
 
 
504 aa  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.14 
 
 
503 aa  48.5  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.14 
 
 
503 aa  47.8  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  25 
 
 
534 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.79 
 
 
508 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.04 
 
 
548 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  25.66 
 
 
543 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  25 
 
 
504 aa  46.2  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  30 
 
 
507 aa  45.4  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  31.48 
 
 
506 aa  45.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.01 
 
 
502 aa  45.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2773  fibronectin, type III  27.97 
 
 
1115 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  28.57 
 
 
507 aa  45.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  28.81 
 
 
504 aa  44.3  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.01 
 
 
502 aa  44.3  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>