98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2410 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 
691 aa  1408    Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.82 
 
 
703 aa  530  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.33 
 
 
662 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.87 
 
 
484 aa  173  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.66 
 
 
484 aa  171  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.11 
 
 
778 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  31.02 
 
 
525 aa  147  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.31 
 
 
501 aa  147  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.14 
 
 
493 aa  145  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.86 
 
 
511 aa  144  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.55 
 
 
507 aa  145  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.66 
 
 
499 aa  143  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  34.44 
 
 
772 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.49 
 
 
510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.21 
 
 
526 aa  140  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  38.36 
 
 
732 aa  140  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  32.04 
 
 
527 aa  139  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  29.57 
 
 
505 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.43 
 
 
501 aa  139  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.03 
 
 
529 aa  137  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.8 
 
 
855 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  28.31 
 
 
506 aa  136  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.34 
 
 
515 aa  136  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.18 
 
 
548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  27.08 
 
 
507 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.49 
 
 
504 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.03 
 
 
826 aa  130  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.05 
 
 
684 aa  130  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.44 
 
 
503 aa  130  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.84 
 
 
502 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.82 
 
 
506 aa  130  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.52 
 
 
511 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.42 
 
 
526 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.73 
 
 
644 aa  128  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.73 
 
 
634 aa  127  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  32.73 
 
 
566 aa  127  8.000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.44 
 
 
514 aa  127  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.3 
 
 
505 aa  126  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.58 
 
 
509 aa  126  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.841612 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  27.64 
 
 
504 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  38.69 
 
 
543 aa  125  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  33.48 
 
 
522 aa  125  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.19 
 
 
504 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.79 
 
 
512 aa  124  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.41 
 
 
502 aa  124  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  33.94 
 
 
502 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.41 
 
 
501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.33 
 
 
502 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.4 
 
 
521 aa  122  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.21 
 
 
492 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.65 
 
 
502 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.17 
 
 
549 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  31.16 
 
 
507 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.41 
 
 
507 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  26.54 
 
 
552 aa  118  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.52 
 
 
500 aa  118  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.81 
 
 
501 aa  117  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.89 
 
 
499 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  25 
 
 
503 aa  117  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  31.49 
 
 
515 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.63 
 
 
508 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.27 
 
 
507 aa  115  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.98 
 
 
661 aa  113  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  28.78 
 
 
448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.62 
 
 
502 aa  112  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.17 
 
 
503 aa  112  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.75 
 
 
535 aa  112  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  24.4 
 
 
512 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.77 
 
 
510 aa  106  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.78 
 
 
501 aa  105  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.43 
 
 
663 aa  104  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  22.22 
 
 
513 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.68 
 
 
824 aa  103  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.04 
 
 
506 aa  102  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.07 
 
 
534 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  25.87 
 
 
534 aa  102  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.96 
 
 
514 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  23.09 
 
 
508 aa  101  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  26.11 
 
 
551 aa  99.4  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  22.34 
 
 
505 aa  97.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.72 
 
 
525 aa  92.4  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  22.75 
 
 
551 aa  91.3  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  25.57 
 
 
505 aa  90.5  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.33 
 
 
515 aa  89.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  22.37 
 
 
660 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25.05 
 
 
704 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25.52 
 
 
704 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  26.92 
 
 
821 aa  70.1  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  28.37 
 
 
699 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0895  alpha-L-arabinofuranosidase  21.66 
 
 
732 aa  59.3  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1170  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  30.69 
 
 
693 aa  58.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000394833  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  24.32 
 
 
679 aa  56.6  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1789  putative alpha-L-arabinofuranosidase  26.9 
 
 
550 aa  53.9  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0379328  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  23.94 
 
 
727 aa  51.2  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  26.25 
 
 
959 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  26.42 
 
 
818 aa  44.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2071  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.44 
 
 
535 aa  44.3  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02541  alpha-arabinofuranosidase (Eurofung)  58.82 
 
 
565 aa  44.3  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>