96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5707 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  64.88 
 
 		 502 aa  675    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  64.09 
 
 		 502 aa  666    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  66.07 
 
 		 502 aa  702    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  64.75 
 
 		 502 aa  675    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  100 
 
 		 507 aa  1056    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  57.14 
 
 		 502 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.47 
 
 		 501 aa  593  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.36 
 
 		 510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.59 
 
 		 503 aa  566  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  55.09 
 
 		 502 aa  560  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.69 
 
 		 505 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.16 
 
 		 514 aa  532  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.9 
 
 		 499 aa  525  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.2 
 
 		 506 aa  510  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  49.8 
 
 		 505 aa  504  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.81 
 
 		 501 aa  502  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  50.2 
 
 		 515 aa  502  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  48.89 
 
 		 525 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  49.1 
 
 		 507 aa  498  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.27 
 
 		 504 aa  492  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.48 
 
 		 504 aa  488  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  47.42 
 
 		 506 aa  489  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.04 
 
 		 507 aa  488  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.6 
 
 		 511 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  49.4 
 
 		 522 aa  481  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.7 
 
 		 507 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.63 
 
 		 515 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  50.1 
 
 		 527 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.55 
 
 		 508 aa  468  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.22 
 
 		 500 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  51.46 
 
 		 448 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.51 
 
 		 512 aa  458  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.63 
 
 		 503 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  44.27 
 
 		 566 aa  448  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.14 
 
 		 499 aa  445  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  43.03 
 
 		 501 aa  444  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.62 
 
 		 501 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.71 
 
 		 548 aa  441  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  36.67 
 
 		 504 aa  303  6.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.99 
 
 		 484 aa  293  4e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.99 
 
 		 484 aa  293  5e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.97 
 
 		 511 aa  275  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  36.63 
 
 		 543 aa  250  4e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.56 
 
 		 534 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.85 
 
 		 549 aa  199  9e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.62 
 
 		 501 aa  196  7e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.3 
 
 		 503 aa  193  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.18 
 
 		 493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.9 
 
 		 492 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.92 
 
 		 513 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.23 
 
 		 514 aa  183  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.77 
 
 		 526 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.65 
 
 		 521 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.25 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  26.17 
 
 		 505 aa  174  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  27.65 
 
 		 534 aa  170  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.86 
 
 		 510 aa  168  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.59 
 
 		 505 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.67 
 
 		 662 aa  166  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.17 
 
 		 507 aa  164  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  28.49 
 
 		 551 aa  163  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.33 
 
 		 535 aa  161  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.88 
 
 		 506 aa  161  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.4 
 
 		 526 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.76 
 
 		 509 aa  159  8e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.44 
 
 		 515 aa  159  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.06 
 
 		 529 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  27.99 
 
 		 552 aa  150  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  27 
 
 		 525 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  41.21 
 
 		 732 aa  141  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  23.58 
 
 		 551 aa  136  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.54 
 
 		 508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.6 
 
 		 691 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.94 
 
 		 778 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.48 
 
 		 772 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.04 
 
 		 703 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.39 
 
 		 684 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  22.3 
 
 		 704 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.3 
 
 		 634 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  22.14 
 
 		 704 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.3 
 
 		 644 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.87 
 
 		 824 aa  68.6  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  21.88 
 
 		 679 aa  67.4  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1789  putative alpha-L-arabinofuranosidase  28.18 
 
 		 550 aa  66.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0379328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.38 
 
 		 826 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.57 
 
 		 663 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.39 
 
 		 660 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  18.99 
 
 		 855 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.07 
 
 		 661 aa  57  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  23.75 
 
 		 821 aa  55.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6365  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25.35 
 
 		 579 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  22.27 
 
 		 818 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  22.13 
 
 		 699 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0895  alpha-L-arabinofuranosidase  22.5 
 
 		 732 aa  45.8  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1170  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  28.57 
 
 		 693 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000394833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25 
 
 		 483 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.219739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>