65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6262 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  100 
 
 
483 aa  976    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  37.34 
 
 
679 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  35.31 
 
 
727 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  33.33 
 
 
699 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  31.95 
 
 
719 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  33.19 
 
 
959 aa  193  7e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  29.2 
 
 
818 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.19 
 
 
484 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.19 
 
 
484 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25.52 
 
 
704 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.51 
 
 
501 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  30.05 
 
 
704 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.83 
 
 
499 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  31.05 
 
 
732 aa  63.9  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6365  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.03 
 
 
579 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15975  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  24.9 
 
 
525 aa  61.6  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.48 
 
 
534 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.74 
 
 
499 aa  60.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  26.14 
 
 
506 aa  60.1  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.91 
 
 
504 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.37 
 
 
508 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.72 
 
 
501 aa  57.8  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  25.63 
 
 
543 aa  56.6  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  27.11 
 
 
504 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.91 
 
 
778 aa  56.6  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.97 
 
 
501 aa  55.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.71 
 
 
503 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  21.57 
 
 
514 aa  55.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2071  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  31.86 
 
 
535 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  24.23 
 
 
505 aa  54.3  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.15 
 
 
493 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.09 
 
 
510 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.46 
 
 
504 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.14 
 
 
512 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.25 
 
 
506 aa  51.2  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  23.05 
 
 
507 aa  51.2  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.77 
 
 
515 aa  50.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  21.51 
 
 
507 aa  50.1  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  23.74 
 
 
772 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.39 
 
 
503 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.28 
 
 
514 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.06 
 
 
525 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.24 
 
 
511 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  20.38 
 
 
501 aa  48.5  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  24.4 
 
 
527 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.22 
 
 
500 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  26.84 
 
 
522 aa  47.8  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.35 
 
 
521 aa  47.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.46 
 
 
507 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.33 
 
 
526 aa  47  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.23 
 
 
503 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  21.77 
 
 
515 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1170  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  25.34 
 
 
693 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000394833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  23.64 
 
 
505 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  22.53 
 
 
534 aa  45.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  25 
 
 
507 aa  45.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  25 
 
 
502 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  21.26 
 
 
502 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.75 
 
 
526 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.76 
 
 
529 aa  44.3  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  24.17 
 
 
513 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.17 
 
 
662 aa  43.9  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.23 
 
 
548 aa  43.5  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.76 
 
 
511 aa  43.5  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.7 
 
 
512 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>