94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1255 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  100 
 
 		 492 aa  1029    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  60 
 
 		 526 aa  650    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  64.84 
 
 		 505 aa  711    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  55.86 
 
 		 512 aa  597  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.29 
 
 		 521 aa  592  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  55.28 
 
 		 513 aa  590  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.19 
 
 		 514 aa  588  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  51.02 
 
 		 505 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.8 
 
 		 507 aa  560  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.29 
 
 		 509 aa  559  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.7 
 
 		 535 aa  553  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  52.28 
 
 		 551 aa  546  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.58 
 
 		 510 aa  547  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.82 
 
 		 525 aa  547  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.89 
 
 		 506 aa  539  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.4 
 
 		 515 aa  539  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  50.1 
 
 		 552 aa  536  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  49.9 
 
 		 534 aa  523  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.4 
 
 		 529 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  43.18 
 
 		 526 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  39.21 
 
 		 501 aa  360  5e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  38.24 
 
 		 551 aa  359  6e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.25 
 
 		 503 aa  344  2.9999999999999997e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  35.83 
 
 		 508 aa  307  2.0000000000000002e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.48 
 
 		 484 aa  278  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.34 
 
 		 484 aa  277  3e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  32.59 
 
 		 504 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.98 
 
 		 501 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.02 
 
 		 499 aa  214  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.08 
 
 		 507 aa  211  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  27.85 
 
 		 525 aa  197  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.82 
 
 		 534 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.38 
 
 		 548 aa  194  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.31 
 
 		 502 aa  193  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.27 
 
 		 501 aa  190  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.43 
 
 		 502 aa  189  9e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.15 
 
 		 499 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  26.9 
 
 		 507 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.84 
 
 		 512 aa  187  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.28 
 
 		 506 aa  186  9e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.93 
 
 		 501 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.88 
 
 		 493 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.88 
 
 		 503 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  27.22 
 
 		 505 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.6 
 
 		 502 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  26 
 
 		 515 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  25.87 
 
 		 506 aa  178  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  29.34 
 
 		 543 aa  178  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.67 
 
 		 501 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.04 
 
 		 505 aa  177  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.64 
 
 		 504 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.97 
 
 		 510 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.83 
 
 		 511 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.77 
 
 		 504 aa  173  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.28 
 
 		 503 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.29 
 
 		 508 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.55 
 
 		 549 aa  171  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.63 
 
 		 514 aa  171  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.69 
 
 		 502 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  30.07 
 
 		 527 aa  169  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.35 
 
 		 507 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.17 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  26.76 
 
 		 448 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  26.29 
 
 		 522 aa  167  4e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.08 
 
 		 502 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.15 
 
 		 507 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  25.65 
 
 		 566 aa  162  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  25.2 
 
 		 515 aa  156  8e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.99 
 
 		 511 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.75 
 
 		 778 aa  146  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.03 
 
 		 500 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.92 
 
 		 662 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.14 
 
 		 684 aa  130  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  39.55 
 
 		 732 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.52 
 
 		 703 aa  127  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.21 
 
 		 691 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.05 
 
 		 772 aa  113  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.87 
 
 		 644 aa  95.1  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.87 
 
 		 634 aa  95.1  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  21.19 
 
 		 704 aa  89  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  21.83 
 
 		 704 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.66 
 
 		 661 aa  84.7  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  21.72 
 
 		 660 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  24.17 
 
 		 679 aa  76.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  31.61 
 
 		 821 aa  72  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  28 
 
 		 824 aa  72.4  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.13 
 
 		 663 aa  67  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  28.88 
 
 		 699 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.56 
 
 		 855 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0895  alpha-L-arabinofuranosidase  22.1 
 
 		 732 aa  60.1  0.00000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.11 
 
 		 826 aa  57.4  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  21.72 
 
 		 959 aa  50.4  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  27.2 
 
 		 818 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  23.42 
 
 		 719 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>