85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3113 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  51.22 
 
 		 660 aa  690    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 661 aa  1370    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.88 
 
 		 824 aa  506  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.27 
 
 		 634 aa  472  1e-132  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.27 
 
 		 644 aa  472  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  38.81 
 
 		 855 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.87 
 
 		 663 aa  426  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.39 
 
 		 826 aa  425  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  34.08 
 
 		 821 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0895  alpha-L-arabinofuranosidase  35.66 
 
 		 732 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02541  alpha-arabinofuranosidase (Eurofung)  27.01 
 
 		 565 aa  157  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.53 
 
 		 684 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.56 
 
 		 703 aa  117  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.57 
 
 		 691 aa  111  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.81 
 
 		 514 aa  103  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  25.65 
 
 		 534 aa  100  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.65 
 
 		 526 aa  98.6  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  24.2 
 
 		 732 aa  96.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.61 
 
 		 772 aa  96.3  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.1 
 
 		 513 aa  94.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.09 
 
 		 529 aa  92  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.22 
 
 		 503 aa  88.2  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  23.69 
 
 		 505 aa  87.8  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  33.54 
 
 		 501 aa  87.4  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.79 
 
 		 511 aa  87  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.95 
 
 		 521 aa  85.9  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  23.66 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  22.24 
 
 		 508 aa  80.5  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  24.25 
 
 		 512 aa  80.5  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  22.22 
 
 		 526 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.72 
 
 		 662 aa  79  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.59 
 
 		 515 aa  77.4  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.09 
 
 		 484 aa  74.3  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.09 
 
 		 484 aa  74.3  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  21.51 
 
 		 534 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  21.77 
 
 		 505 aa  73.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.18 
 
 		 503 aa  70.9  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.91 
 
 		 504 aa  70.9  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  25.99 
 
 		 525 aa  70.1  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.22 
 
 		 535 aa  68.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.38 
 
 		 509 aa  66.6  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  25 
 
 		 501 aa  67  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.22 
 
 		 499 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.78 
 
 		 778 aa  66.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.37 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  26.73 
 
 		 504 aa  64.3  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.82 
 
 		 506 aa  64.3  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  27.32 
 
 		 543 aa  63.5  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.78 
 
 		 548 aa  63.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.11 
 
 		 525 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.64 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  27.81 
 
 		 551 aa  62.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.44 
 
 		 507 aa  62  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.63 
 
 		 510 aa  61.6  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  25.65 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  24.48 
 
 		 515 aa  60.5  0.00000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  26.58 
 
 		 527 aa  59.3  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.88 
 
 		 551 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.36 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  24.07 
 
 		 507 aa  57  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.77 
 
 		 502 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  27.67 
 
 		 448 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.24 
 
 		 511 aa  56.6  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.42 
 
 		 501 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.47 
 
 		 502 aa  55.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  24.46 
 
 		 522 aa  55.1  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.09 
 
 		 503 aa  55.1  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  23.28 
 
 		 505 aa  54.3  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.12 
 
 		 502 aa  53.9  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.38 
 
 		 502 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.81 
 
 		 514 aa  52.4  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.88 
 
 		 504 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  23.46 
 
 		 506 aa  52.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.09 
 
 		 507 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.04 
 
 		 499 aa  52  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.88 
 
 		 493 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  21.13 
 
 		 549 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.88 
 
 		 507 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.84 
 
 		 506 aa  49.3  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  23.42 
 
 		 566 aa  47.8  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.12 
 
 		 501 aa  46.2  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.95 
 
 		 508 aa  45.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.04 
 
 		 505 aa  45.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  21.6 
 
 		 502 aa  44.3  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  20.31 
 
 		 501 aa  43.9  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>