96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4317 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 
504 aa  1040    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  62.3 
 
 
505 aa  645    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  60 
 
 
506 aa  606  9.999999999999999e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  59.68 
 
 
504 aa  598  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  66.67 
 
 
448 aa  597  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  58.68 
 
 
507 aa  588  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  59.52 
 
 
500 aa  585  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  57.77 
 
 
525 aa  568  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  54.09 
 
 
502 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.02 
 
 
501 aa  567  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  57.29 
 
 
501 aa  566  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  56.78 
 
 
507 aa  561  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.42 
 
 
499 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.18 
 
 
507 aa  561  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  57.37 
 
 
503 aa  561  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.49 
 
 
506 aa  556  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.2 
 
 
510 aa  557  1e-157  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.49 
 
 
503 aa  552  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  56.86 
 
 
508 aa  552  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.71 
 
 
511 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  53.91 
 
 
502 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.93 
 
 
502 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.73 
 
 
502 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.3 
 
 
505 aa  532  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.8 
 
 
515 aa  533  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.94 
 
 
512 aa  525  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.39 
 
 
514 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  53.19 
 
 
527 aa  514  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  53.39 
 
 
522 aa  509  1e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  53.42 
 
 
515 aa  502  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.31 
 
 
502 aa  499  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  48.27 
 
 
507 aa  492  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.91 
 
 
502 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  44.53 
 
 
501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  45.51 
 
 
566 aa  449  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.47 
 
 
548 aa  427  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.32 
 
 
501 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.04 
 
 
499 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.61 
 
 
484 aa  291  3e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.61 
 
 
484 aa  290  4e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  35.18 
 
 
504 aa  283  7.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  33.54 
 
 
543 aa  258  1e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.06 
 
 
511 aa  232  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.53 
 
 
534 aa  232  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.11 
 
 
493 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.75 
 
 
503 aa  201  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.23 
 
 
514 aa  201  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.38 
 
 
501 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.71 
 
 
549 aa  189  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.46 
 
 
510 aa  183  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.69 
 
 
507 aa  179  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.02 
 
 
505 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.46 
 
 
526 aa  179  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.75 
 
 
515 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.36 
 
 
512 aa  176  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.31 
 
 
535 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.01 
 
 
513 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.49 
 
 
521 aa  174  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.77 
 
 
492 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  30.36 
 
 
551 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  30.06 
 
 
552 aa  172  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.95 
 
 
662 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  28.29 
 
 
534 aa  169  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.62 
 
 
509 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.09 
 
 
506 aa  156  9e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.75 
 
 
732 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  27.67 
 
 
505 aa  153  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.31 
 
 
525 aa  147  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.34 
 
 
529 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  26 
 
 
526 aa  141  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.1 
 
 
778 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.96 
 
 
508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.35 
 
 
772 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.05 
 
 
691 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.22 
 
 
551 aa  117  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.88 
 
 
703 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25.22 
 
 
704 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.52 
 
 
684 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  27.92 
 
 
704 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  24.12 
 
 
679 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1789  putative alpha-L-arabinofuranosidase  29.1 
 
 
550 aa  75.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0379328  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.76 
 
 
644 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.76 
 
 
634 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.07 
 
 
824 aa  63.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.91 
 
 
483 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  25.33 
 
 
699 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.31 
 
 
826 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.92 
 
 
663 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.07 
 
 
959 aa  53.9  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.88 
 
 
661 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.56 
 
 
660 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.97 
 
 
855 aa  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2382  hypothetical protein  27.78 
 
 
1002 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1170  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  33.94 
 
 
693 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000394833  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6365  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.78 
 
 
579 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15975  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2071  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  21.68 
 
 
535 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>