94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2727 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  64.84 
 
 		 492 aa  711    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  100 
 
 		 505 aa  1063    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  61.51 
 
 		 526 aa  644    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  54.64 
 
 		 513 aa  592  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.42 
 
 		 514 aa  588  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.96 
 
 		 507 aa  589  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  56.56 
 
 		 521 aa  590  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  56.02 
 
 		 551 aa  588  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  56.34 
 
 		 512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.95 
 
 		 509 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  54.81 
 
 		 552 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.81 
 
 		 510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.87 
 
 		 506 aa  570  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  54.1 
 
 		 505 aa  569  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.68 
 
 		 515 aa  560  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.29 
 
 		 525 aa  553  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.55 
 
 		 535 aa  552  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  52.37 
 
 		 534 aa  535  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.99 
 
 		 529 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  47.61 
 
 		 526 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.57 
 
 		 503 aa  358  9.999999999999999e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  38.6 
 
 		 501 aa  348  2e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  37.76 
 
 		 551 aa  342  8e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  38.16 
 
 		 508 aa  335  1e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.12 
 
 		 484 aa  251  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.33 
 
 		 484 aa  250  4e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.8 
 
 		 501 aa  217  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.72 
 
 		 499 aa  216  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  32.5 
 
 		 504 aa  209  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.78 
 
 		 534 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.18 
 
 		 548 aa  193  8e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.01 
 
 		 493 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.98 
 
 		 506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.34 
 
 		 507 aa  181  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  27.2 
 
 		 505 aa  182  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  29.24 
 
 		 543 aa  180  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.36 
 
 		 499 aa  180  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.43 
 
 		 514 aa  179  9e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.02 
 
 		 504 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.53 
 
 		 503 aa  176  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.93 
 
 		 501 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.3 
 
 		 505 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.9 
 
 		 501 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.79 
 
 		 502 aa  171  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.87 
 
 		 507 aa  170  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.94 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  26.59 
 
 		 507 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.33 
 
 		 510 aa  167  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.01 
 
 		 508 aa  166  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.62 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.14 
 
 		 549 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  26.1 
 
 		 525 aa  164  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.25 
 
 		 502 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.72 
 
 		 502 aa  163  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.72 
 
 		 502 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.4 
 
 		 504 aa  162  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.37 
 
 		 503 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  25.2 
 
 		 506 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  27.32 
 
 		 448 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  26.26 
 
 		 522 aa  158  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.12 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  25.94 
 
 		 566 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.39 
 
 		 507 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  28.71 
 
 		 527 aa  150  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.64 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  25 
 
 		 515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.1 
 
 		 515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  24.45 
 
 		 501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.78 
 
 		 662 aa  147  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.03 
 
 		 511 aa  146  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  24.7 
 
 		 502 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.95 
 
 		 778 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  39.43 
 
 		 732 aa  133  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.39 
 
 		 684 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.37 
 
 		 703 aa  117  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.22 
 
 		 772 aa  110  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.34 
 
 		 691 aa  97.1  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.26 
 
 		 634 aa  93.2  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.26 
 
 		 644 aa  93.2  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.69 
 
 		 661 aa  87.8  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  22.11 
 
 		 660 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  22 
 
 		 704 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  22.22 
 
 		 704 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.13 
 
 		 663 aa  71.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  26.21 
 
 		 679 aa  70.5  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.68 
 
 		 824 aa  69.3  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.32 
 
 		 826 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.85 
 
 		 855 aa  64.7  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0895  alpha-L-arabinofuranosidase  26.83 
 
 		 732 aa  62  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  23.44 
 
 		 699 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  27.81 
 
 		 821 aa  60.1  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  27.54 
 
 		 818 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  22.93 
 
 		 959 aa  54.3  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.64 
 
 		 483 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.219739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>