95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2782 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  71.51 
 
 
510 aa  749    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  67.86 
 
 
506 aa  723    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  74.75 
 
 
551 aa  779    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  76.69 
 
 
552 aa  808    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  64.75 
 
 
535 aa  657    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  61.09 
 
 
515 aa  635    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 
507 aa  1033    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  74.41 
 
 
509 aa  789    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  54.96 
 
 
505 aa  589  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  51.8 
 
 
492 aa  560  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.67 
 
 
526 aa  532  1e-150  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.9 
 
 
514 aa  533  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  51.79 
 
 
505 aa  529  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  50 
 
 
513 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  50.41 
 
 
512 aa  520  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.06 
 
 
525 aa  514  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.29 
 
 
521 aa  500  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  46.39 
 
 
534 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.03 
 
 
529 aa  436  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  41.85 
 
 
526 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.27 
 
 
503 aa  348  1e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  40.36 
 
 
501 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  36.49 
 
 
551 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  34.02 
 
 
508 aa  275  2.0000000000000002e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.66 
 
 
484 aa  266  7e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.45 
 
 
484 aa  265  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  34.81 
 
 
504 aa  196  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.18 
 
 
548 aa  191  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.97 
 
 
534 aa  186  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.69 
 
 
504 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.36 
 
 
501 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  31.94 
 
 
543 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.63 
 
 
506 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.19 
 
 
501 aa  170  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.55 
 
 
514 aa  169  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.69 
 
 
499 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.01 
 
 
502 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.44 
 
 
510 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.91 
 
 
507 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  28.17 
 
 
507 aa  164  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  30.27 
 
 
505 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.94 
 
 
499 aa  160  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.91 
 
 
549 aa  160  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.52 
 
 
505 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  28.96 
 
 
525 aa  156  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.63 
 
 
508 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.13 
 
 
504 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.88 
 
 
512 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.16 
 
 
501 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.52 
 
 
502 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  26.97 
 
 
522 aa  153  8e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.52 
 
 
502 aa  153  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  28.71 
 
 
506 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.18 
 
 
501 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.22 
 
 
502 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.65 
 
 
507 aa  150  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.49 
 
 
502 aa  150  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  27 
 
 
503 aa  147  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.67 
 
 
493 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.96 
 
 
503 aa  147  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.16 
 
 
500 aa  146  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.16 
 
 
507 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  27.59 
 
 
566 aa  144  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.66 
 
 
511 aa  143  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  31.97 
 
 
448 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.64 
 
 
511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  28.33 
 
 
515 aa  139  7.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.56 
 
 
778 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.08 
 
 
662 aa  137  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.05 
 
 
502 aa  136  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.53 
 
 
515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  28.07 
 
 
527 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  45.6 
 
 
732 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.42 
 
 
703 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.27 
 
 
691 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.11 
 
 
684 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  39.55 
 
 
772 aa  99  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  24.4 
 
 
660 aa  80.9  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  31.71 
 
 
704 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.57 
 
 
644 aa  69.7  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.9 
 
 
634 aa  69.7  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  34.78 
 
 
704 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.59 
 
 
824 aa  67.8  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.44 
 
 
661 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  25.73 
 
 
679 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  30.52 
 
 
821 aa  60.8  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0895  alpha-L-arabinofuranosidase  28.83 
 
 
732 aa  59.3  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.87 
 
 
663 aa  57  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  31.46 
 
 
959 aa  52.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  28.68 
 
 
699 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.32 
 
 
855 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1789  putative alpha-L-arabinofuranosidase  28.03 
 
 
550 aa  49.7  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0379328  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  26.43 
 
 
719 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.43 
 
 
826 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  28.32 
 
 
818 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>