95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1739 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  100 
 
 
522 aa  1077    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  80.47 
 
 
515 aa  864    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  58.12 
 
 
507 aa  566  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  56.36 
 
 
525 aa  567  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.34 
 
 
507 aa  558  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  56.04 
 
 
501 aa  544  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  55.05 
 
 
506 aa  544  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.3 
 
 
511 aa  538  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.46 
 
 
504 aa  538  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  56.5 
 
 
507 aa  535  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.45 
 
 
515 aa  531  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.39 
 
 
504 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.33 
 
 
500 aa  511  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.44 
 
 
508 aa  511  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  51.47 
 
 
505 aa  505  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.39 
 
 
503 aa  504  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.75 
 
 
503 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  51.66 
 
 
566 aa  492  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  47.95 
 
 
502 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.51 
 
 
501 aa  490  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  58.37 
 
 
448 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.51 
 
 
499 aa  484  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  49.4 
 
 
507 aa  481  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.62 
 
 
506 aa  483  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  50.38 
 
 
527 aa  478  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.46 
 
 
514 aa  476  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.49 
 
 
512 aa  475  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  47.36 
 
 
502 aa  472  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.58 
 
 
502 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.35 
 
 
510 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.58 
 
 
502 aa  463  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.97 
 
 
502 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.19 
 
 
502 aa  461  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.42 
 
 
505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  40.43 
 
 
501 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.19 
 
 
548 aa  372  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.43 
 
 
501 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.04 
 
 
499 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.56 
 
 
484 aa  276  5e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.56 
 
 
484 aa  276  9e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  34.26 
 
 
504 aa  268  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  33.33 
 
 
543 aa  240  4e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.74 
 
 
511 aa  225  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.39 
 
 
549 aa  194  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.22 
 
 
501 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.1 
 
 
503 aa  180  5.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.39 
 
 
534 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.49 
 
 
526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.46 
 
 
514 aa  168  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.29 
 
 
492 aa  167  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  27.57 
 
 
534 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.37 
 
 
493 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.33 
 
 
512 aa  163  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.6 
 
 
526 aa  163  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  27 
 
 
521 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.99 
 
 
662 aa  160  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  29.08 
 
 
505 aa  159  9e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.26 
 
 
505 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  28.33 
 
 
551 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.66 
 
 
510 aa  157  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.19 
 
 
513 aa  156  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.48 
 
 
515 aa  154  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.97 
 
 
507 aa  153  8e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.2 
 
 
535 aa  150  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  28.31 
 
 
552 aa  147  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.03 
 
 
506 aa  142  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.72 
 
 
525 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.94 
 
 
509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.42 
 
 
732 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.56 
 
 
529 aa  131  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.48 
 
 
691 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.47 
 
 
778 aa  121  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.04 
 
 
551 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.31 
 
 
508 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  32 
 
 
703 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.11 
 
 
772 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.82 
 
 
684 aa  87  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.19 
 
 
704 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  23.31 
 
 
679 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.14 
 
 
704 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.57 
 
 
663 aa  64.3  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.93 
 
 
826 aa  63.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1789  putative alpha-L-arabinofuranosidase  28.42 
 
 
550 aa  63.5  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0379328  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.35 
 
 
644 aa  62  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.68 
 
 
634 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.39 
 
 
824 aa  57.8  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  26.09 
 
 
821 aa  56.2  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.1 
 
 
855 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.46 
 
 
661 aa  55.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0895  alpha-L-arabinofuranosidase  25 
 
 
732 aa  53.9  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6365  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.66 
 
 
579 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15975  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2382  hypothetical protein  24.39 
 
 
1002 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.32 
 
 
660 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  25.57 
 
 
699 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  26.84 
 
 
483 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.219739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>