98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH00030 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  100 
 
 
543 aa  1131    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  46.76 
 
 
504 aa  414  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.59 
 
 
484 aa  301  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.06 
 
 
501 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.17 
 
 
484 aa  300  3e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.68 
 
 
499 aa  293  7e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.44 
 
 
514 aa  281  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.07 
 
 
548 aa  280  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.2 
 
 
506 aa  267  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.66 
 
 
502 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.59 
 
 
502 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.03 
 
 
502 aa  260  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.54 
 
 
504 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.66 
 
 
504 aa  254  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  37.71 
 
 
448 aa  253  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.7 
 
 
499 aa  252  9.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  36.63 
 
 
507 aa  250  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.03 
 
 
507 aa  250  4e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  37.14 
 
 
525 aa  249  7e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  33.87 
 
 
505 aa  249  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.47 
 
 
501 aa  247  4.9999999999999997e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.35 
 
 
534 aa  246  9e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.77 
 
 
503 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  35.02 
 
 
502 aa  243  5e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.19 
 
 
505 aa  243  7.999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.67 
 
 
502 aa  243  9e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  33.86 
 
 
502 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.52 
 
 
515 aa  241  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  33.4 
 
 
506 aa  240  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  33.33 
 
 
522 aa  240  4e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.99 
 
 
511 aa  237  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.81 
 
 
500 aa  236  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.12 
 
 
510 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  35 
 
 
501 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  33.47 
 
 
515 aa  234  3e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  37.19 
 
 
527 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  32.87 
 
 
507 aa  233  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  33.98 
 
 
566 aa  229  9e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.73 
 
 
512 aa  216  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.78 
 
 
493 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.7 
 
 
507 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  34.49 
 
 
501 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.38 
 
 
503 aa  208  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.38 
 
 
503 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  32.51 
 
 
501 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.98 
 
 
526 aa  198  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.29 
 
 
549 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.25 
 
 
508 aa  196  8.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  31.09 
 
 
512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.47 
 
 
514 aa  191  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.8 
 
 
513 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.88 
 
 
510 aa  183  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  30.19 
 
 
552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.24 
 
 
505 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.94 
 
 
511 aa  180  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.68 
 
 
662 aa  180  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.34 
 
 
492 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.95 
 
 
521 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.83 
 
 
509 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  32 
 
 
535 aa  177  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  47.67 
 
 
732 aa  176  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.94 
 
 
507 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  28.17 
 
 
534 aa  173  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  28.19 
 
 
505 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  28.6 
 
 
551 aa  168  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.17 
 
 
506 aa  162  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.66 
 
 
515 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.57 
 
 
525 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.64 
 
 
508 aa  152  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.41 
 
 
529 aa  151  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.02 
 
 
778 aa  149  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.91 
 
 
526 aa  140  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.99 
 
 
703 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.69 
 
 
691 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  41.21 
 
 
772 aa  123  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.3 
 
 
551 aa  120  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.14 
 
 
684 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  26.56 
 
 
704 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  29.56 
 
 
699 aa  80.5  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25.91 
 
 
704 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  27.64 
 
 
679 aa  71.6  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  26.61 
 
 
821 aa  70.9  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1789  putative alpha-L-arabinofuranosidase  29.21 
 
 
550 aa  70.1  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0379328  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  28.44 
 
 
959 aa  68.6  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2071  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23 
 
 
535 aa  67.8  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.74 
 
 
824 aa  67.4  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.18 
 
 
634 aa  63.5  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.32 
 
 
661 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.18 
 
 
644 aa  63.5  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  29.87 
 
 
818 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.14 
 
 
660 aa  60.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.71 
 
 
855 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  25 
 
 
826 aa  58.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.83 
 
 
663 aa  57.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25.63 
 
 
483 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  24.59 
 
 
727 aa  47.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1170  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  25.56 
 
 
693 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000394833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  26.09 
 
 
719 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>