94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2725 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  64.39 
 
 		 499 aa  679    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  63.8 
 
 		 514 aa  673    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  66.8 
 
 		 501 aa  715    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  100 
 
 		 502 aa  1047    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  65.01 
 
 		 505 aa  711    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  66.6 
 
 		 510 aa  706    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  70.91 
 
 		 502 aa  731    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  68.13 
 
 		 503 aa  734    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  58.72 
 
 		 502 aa  628  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  58.12 
 
 		 502 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  57.14 
 
 		 507 aa  602  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  56 
 
 		 502 aa  593  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  53.83 
 
 		 501 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.09 
 
 		 504 aa  566  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.56 
 
 		 506 aa  561  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  51.41 
 
 		 505 aa  553  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.3 
 
 		 502 aa  548  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.5 
 
 		 504 aa  544  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  50.1 
 
 		 525 aa  536  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.3 
 
 		 501 aa  532  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  49.11 
 
 		 506 aa  527  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.21 
 
 		 507 aa  522  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  50.8 
 
 		 507 aa  521  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.41 
 
 		 507 aa  510  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.5 
 
 		 503 aa  509  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.6 
 
 		 500 aa  507  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.4 
 
 		 508 aa  504  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.5 
 
 		 511 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.28 
 
 		 515 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  47.95 
 
 		 522 aa  489  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  47.94 
 
 		 515 aa  487  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  53.78 
 
 		 527 aa  487  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  53.49 
 
 		 448 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  45.56 
 
 		 566 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.81 
 
 		 548 aa  450  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.88 
 
 		 512 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.78 
 
 		 501 aa  444  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.15 
 
 		 499 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  37.03 
 
 		 504 aa  298  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.9 
 
 		 484 aa  296  5e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.9 
 
 		 484 aa  296  9e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.59 
 
 		 511 aa  291  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  33.86 
 
 		 543 aa  241  2e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.08 
 
 		 534 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.21 
 
 		 493 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.07 
 
 		 501 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.5 
 
 		 549 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.08 
 
 		 503 aa  187  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.39 
 
 		 514 aa  186  6e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.79 
 
 		 526 aa  186  7e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.8 
 
 		 521 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.6 
 
 		 492 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.87 
 
 		 513 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.83 
 
 		 662 aa  169  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.55 
 
 		 512 aa  169  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.65 
 
 		 535 aa  168  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.01 
 
 		 507 aa  166  9e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.24 
 
 		 510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  27.94 
 
 		 551 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  33.59 
 
 		 534 aa  164  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.25 
 
 		 505 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  26.63 
 
 		 505 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.4 
 
 		 506 aa  162  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.22 
 
 		 529 aa  161  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.69 
 
 		 526 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.84 
 
 		 515 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  27.03 
 
 		 552 aa  153  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.69 
 
 		 509 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.42 
 
 		 551 aa  143  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  39.25 
 
 		 732 aa  141  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.7 
 
 		 525 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.84 
 
 		 691 aa  130  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.74 
 
 		 508 aa  130  7.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.47 
 
 		 778 aa  129  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.53 
 
 		 772 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.72 
 
 		 703 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.15 
 
 		 684 aa  96.3  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25.47 
 
 		 704 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1789  putative alpha-L-arabinofuranosidase  31.87 
 
 		 550 aa  72.4  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0379328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.53 
 
 		 704 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.39 
 
 		 644 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.39 
 
 		 634 aa  66.6  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.92 
 
 		 663 aa  60.8  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.69 
 
 		 826 aa  60.1  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  25.48 
 
 		 699 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  25.62 
 
 		 821 aa  58.9  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  22.81 
 
 		 679 aa  57.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1170  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  33.76 
 
 		 693 aa  57  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000394833  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.39 
 
 		 660 aa  53.9  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.32 
 
 		 824 aa  53.9  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.38 
 
 		 661 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  24.03 
 
 		 855 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.55 
 
 		 959 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.94 
 
 		 818 aa  43.5  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>