96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1374 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  60 
 
 		 492 aa  652    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  58.51 
 
 		 521 aa  647    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 526 aa  1098    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  61.51 
 
 		 505 aa  645    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  59 
 
 		 513 aa  618  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  58.43 
 
 		 512 aa  618  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  57.14 
 
 		 505 aa  601  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.19 
 
 		 514 aa  579  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.65 
 
 		 509 aa  566  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  52.82 
 
 		 534 aa  550  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.62 
 
 		 510 aa  542  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.06 
 
 		 506 aa  540  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.36 
 
 		 515 aa  536  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.36 
 
 		 507 aa  533  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.29 
 
 		 535 aa  527  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  50.37 
 
 		 551 aa  525  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  49.82 
 
 		 552 aa  523  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.71 
 
 		 525 aa  519  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.9 
 
 		 529 aa  520  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  47.68 
 
 		 526 aa  503  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  36.36 
 
 		 551 aa  349  6e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.01 
 
 		 503 aa  339  9e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  37.18 
 
 		 501 aa  330  3e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  34.91 
 
 		 508 aa  286  9e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.69 
 
 		 484 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.69 
 
 		 484 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  34.03 
 
 		 504 aa  225  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.43 
 
 		 501 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.04 
 
 		 548 aa  211  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.55 
 
 		 499 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.82 
 
 		 507 aa  207  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  30 
 
 		 543 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.06 
 
 		 534 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  28.25 
 
 		 566 aa  192  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.32 
 
 		 501 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  27.64 
 
 		 506 aa  189  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.74 
 
 		 512 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.56 
 
 		 502 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  28.15 
 
 		 525 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.54 
 
 		 507 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.29 
 
 		 507 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.56 
 
 		 514 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.19 
 
 		 511 aa  179  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.95 
 
 		 506 aa  179  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.46 
 
 		 504 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.67 
 
 		 505 aa  178  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  26.77 
 
 		 507 aa  179  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.81 
 
 		 515 aa  179  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.4 
 
 		 502 aa  178  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  27.25 
 
 		 505 aa  177  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.8 
 
 		 508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  27.49 
 
 		 522 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.42 
 
 		 501 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.51 
 
 		 493 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.37 
 
 		 499 aa  171  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  29.26 
 
 		 527 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.24 
 
 		 510 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.8 
 
 		 502 aa  171  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.84 
 
 		 502 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  29.47 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.65 
 
 		 502 aa  167  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.76 
 
 		 511 aa  167  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.33 
 
 		 504 aa  164  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.73 
 
 		 503 aa  164  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  26.43 
 
 		 515 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.98 
 
 		 501 aa  163  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.94 
 
 		 662 aa  160  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.63 
 
 		 503 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.83 
 
 		 500 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.81 
 
 		 502 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.01 
 
 		 549 aa  151  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.47 
 
 		 778 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.21 
 
 		 691 aa  141  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  39.89 
 
 		 732 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.97 
 
 		 684 aa  133  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.25 
 
 		 703 aa  129  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.85 
 
 		 772 aa  126  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.65 
 
 		 661 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  22.93 
 
 		 660 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25.48 
 
 		 704 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25 
 
 		 704 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.96 
 
 		 644 aa  88.2  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.96 
 
 		 634 aa  88.2  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.06 
 
 		 663 aa  81.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  25.42 
 
 		 679 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  23.31 
 
 		 699 aa  77.4  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.84 
 
 		 824 aa  73.9  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.59 
 
 		 826 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  24.88 
 
 		 821 aa  65.9  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0895  alpha-L-arabinofuranosidase  21.84 
 
 		 732 aa  63.5  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.27 
 
 		 855 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  22.55 
 
 		 959 aa  56.6  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  26.35 
 
 		 818 aa  53.9  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1789  putative alpha-L-arabinofuranosidase  26.44 
 
 		 550 aa  49.3  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0379328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.37 
 
 		 483 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  23.68 
 
 		 719 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>