95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1817 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 
548 aa  1130    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.52 
 
 
506 aa  463  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.44 
 
 
501 aa  459  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.62 
 
 
502 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.02 
 
 
502 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  43.81 
 
 
502 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  46.61 
 
 
502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.58 
 
 
499 aa  445  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  45.71 
 
 
507 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.96 
 
 
503 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.05 
 
 
501 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.08 
 
 
514 aa  435  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.5 
 
 
505 aa  434  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.38 
 
 
510 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.47 
 
 
504 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  44.08 
 
 
507 aa  425  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.45 
 
 
499 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  43.2 
 
 
525 aa  414  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.64 
 
 
507 aa  413  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.15 
 
 
504 aa  411  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  42.75 
 
 
505 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.41 
 
 
502 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.4 
 
 
502 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.72 
 
 
507 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.08 
 
 
501 aa  401  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  47.9 
 
 
448 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.27 
 
 
515 aa  393  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  43.15 
 
 
506 aa  392  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.27 
 
 
511 aa  395  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.2 
 
 
500 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.86 
 
 
503 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.33 
 
 
508 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  40.19 
 
 
522 aa  372  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  41.18 
 
 
527 aa  372  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  41.51 
 
 
515 aa  367  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  37.4 
 
 
501 aa  360  5e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  36.84 
 
 
566 aa  347  4e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.27 
 
 
484 aa  322  8e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.27 
 
 
484 aa  322  8e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  37.42 
 
 
504 aa  322  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  34.07 
 
 
543 aa  280  4e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.51 
 
 
534 aa  247  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.01 
 
 
511 aa  234  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.27 
 
 
493 aa  225  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.46 
 
 
513 aa  215  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.04 
 
 
526 aa  211  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.66 
 
 
512 aa  210  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.81 
 
 
514 aa  209  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.07 
 
 
549 aa  207  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.81 
 
 
529 aa  206  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.83 
 
 
521 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.65 
 
 
501 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.33 
 
 
526 aa  195  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.38 
 
 
492 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.18 
 
 
505 aa  193  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  28.24 
 
 
551 aa  192  9e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.19 
 
 
509 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.18 
 
 
507 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  28.89 
 
 
552 aa  189  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  28.54 
 
 
534 aa  189  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.79 
 
 
515 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.24 
 
 
503 aa  188  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.73 
 
 
662 aa  186  8e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.63 
 
 
506 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.47 
 
 
510 aa  184  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.47 
 
 
535 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  27.51 
 
 
505 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.16 
 
 
525 aa  177  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.58 
 
 
732 aa  162  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.31 
 
 
778 aa  157  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.12 
 
 
508 aa  155  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.32 
 
 
551 aa  140  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.79 
 
 
703 aa  137  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.18 
 
 
691 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.95 
 
 
772 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.69 
 
 
684 aa  103  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25.3 
 
 
704 aa  100  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  26.89 
 
 
704 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  24.32 
 
 
679 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1789  putative alpha-L-arabinofuranosidase  29.03 
 
 
550 aa  70.5  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0379328  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.22 
 
 
824 aa  67  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  25.56 
 
 
699 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.73 
 
 
644 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.73 
 
 
634 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  26.25 
 
 
821 aa  65.1  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.76 
 
 
818 aa  63.5  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.78 
 
 
661 aa  63.5  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.3 
 
 
660 aa  60.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.06 
 
 
826 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.32 
 
 
663 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  27.94 
 
 
959 aa  49.7  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  24.03 
 
 
855 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1170  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  23.04 
 
 
693 aa  47  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000394833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.23 
 
 
483 aa  43.5  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.219739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>