62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3118 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  100 
 
 		 818 aa  1667    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  36.12 
 
 		 959 aa  251  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  34.81 
 
 		 727 aa  234  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  33.33 
 
 		 699 aa  226  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  34.32 
 
 		 679 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  32.88 
 
 		 719 aa  173  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  29.2 
 
 		 483 aa  151  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1170  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  26.51 
 
 		 693 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000394833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2773  fibronectin, type III  36.99 
 
 		 1115 aa  87.4  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2071  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  26.03 
 
 		 535 aa  85.9  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  31.84 
 
 		 732 aa  79  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6365  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.77 
 
 		 579 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.36 
 
 		 503 aa  74.3  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  26.37 
 
 		 504 aa  74.3  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.04 
 
 		 778 aa  73.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  26.78 
 
 		 704 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.94 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.77 
 
 		 484 aa  72  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  26.21 
 
 		 704 aa  67  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.74 
 
 		 502 aa  67.4  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  31.33 
 
 		 501 aa  65.1  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.12 
 
 		 501 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.17 
 
 		 534 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.76 
 
 		 548 aa  63.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  29.87 
 
 		 543 aa  62.4  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.64 
 
 		 499 aa  62  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.27 
 
 		 508 aa  57.4  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.86 
 
 		 521 aa  56.2  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.54 
 
 		 505 aa  55.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  22.89 
 
 		 448 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.97 
 
 		 514 aa  54.7  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.69 
 
 		 772 aa  54.3  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.09 
 
 		 493 aa  53.9  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.4 
 
 		 501 aa  53.9  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.15 
 
 		 503 aa  53.9  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.66 
 
 		 529 aa  53.9  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.35 
 
 		 526 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.29 
 
 		 525 aa  53.5  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.78 
 
 		 515 aa  52.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  32.46 
 
 		 512 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  22.27 
 
 		 507 aa  52.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  28 
 
 		 535 aa  51.6  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  21.76 
 
 		 502 aa  51.2  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  24.26 
 
 		 513 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.77 
 
 		 499 aa  49.7  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  26.98 
 
 		 527 aa  49.3  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  25.55 
 
 		 552 aa  47.8  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.11 
 
 		 514 aa  47.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  27.01 
 
 		 551 aa  47.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  28.93 
 
 		 534 aa  47.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  21.02 
 
 		 503 aa  47  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.2 
 
 		 492 aa  46.6  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  24.24 
 
 		 505 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.78 
 
 		 662 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.43 
 
 		 506 aa  45.8  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.15 
 
 		 510 aa  45.8  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  23.41 
 
 		 501 aa  45.4  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  23.16 
 
 		 551 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.01 
 
 		 507 aa  45.4  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2309  carbohydrate binding protein  24.06 
 
 		 708 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.427947 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.07 
 
 		 509 aa  44.7  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.42 
 
 		 691 aa  44.7  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>