88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0330 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 
663 aa  1352    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  47.26 
 
 
855 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  38.83 
 
 
660 aa  462  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.3 
 
 
824 aa  435  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  39.69 
 
 
821 aa  431  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.71 
 
 
661 aa  429  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.9 
 
 
826 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.8 
 
 
634 aa  422  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.8 
 
 
644 aa  420  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0895  alpha-L-arabinofuranosidase  32.19 
 
 
732 aa  272  1e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02541  alpha-arabinofuranosidase (Eurofung)  30.31 
 
 
565 aa  163  8.000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.06 
 
 
684 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.31 
 
 
691 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.69 
 
 
703 aa  90.5  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.93 
 
 
662 aa  87.4  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.75 
 
 
772 aa  82  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.06 
 
 
526 aa  81.6  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.62 
 
 
499 aa  80.5  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.82 
 
 
511 aa  78.6  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.02 
 
 
778 aa  77  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.14 
 
 
514 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  19.71 
 
 
484 aa  73.9  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.45 
 
 
529 aa  73.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.87 
 
 
501 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  19.71 
 
 
484 aa  72.8  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.57 
 
 
493 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.07 
 
 
732 aa  73.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.66 
 
 
521 aa  72.4  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.13 
 
 
505 aa  72  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.67 
 
 
501 aa  70.9  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.6 
 
 
512 aa  70.5  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.03 
 
 
513 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.75 
 
 
534 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.13 
 
 
492 aa  67  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  30.52 
 
 
525 aa  65.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  30.52 
 
 
527 aa  65.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.22 
 
 
507 aa  66.2  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.92 
 
 
501 aa  65.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.1 
 
 
507 aa  65.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  28.57 
 
 
507 aa  65.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  26.26 
 
 
566 aa  64.7  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  21.04 
 
 
534 aa  64.3  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  28.57 
 
 
522 aa  64.3  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  28.57 
 
 
506 aa  63.5  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.03 
 
 
508 aa  62.4  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.03 
 
 
504 aa  61.6  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  26.62 
 
 
504 aa  62  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  28.57 
 
 
515 aa  61.6  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.88 
 
 
503 aa  61.2  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.92 
 
 
502 aa  60.8  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.62 
 
 
503 aa  60.5  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.49 
 
 
502 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.57 
 
 
509 aa  60.1  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.92 
 
 
512 aa  60.1  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  29.45 
 
 
551 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.95 
 
 
503 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.17 
 
 
501 aa  58.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.1 
 
 
502 aa  58.5  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  26.83 
 
 
543 aa  57.8  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.63 
 
 
526 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.1 
 
 
515 aa  57.4  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.97 
 
 
506 aa  57  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.22 
 
 
515 aa  57  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.87 
 
 
507 aa  57  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.27 
 
 
510 aa  56.6  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.32 
 
 
548 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.1 
 
 
549 aa  55.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.92 
 
 
504 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.92 
 
 
510 aa  54.3  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.23 
 
 
502 aa  54.7  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.67 
 
 
511 aa  54.7  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.39 
 
 
514 aa  54.7  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.27 
 
 
535 aa  54.7  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.75 
 
 
507 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.54 
 
 
505 aa  53.5  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.92 
 
 
506 aa  52.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  22.44 
 
 
508 aa  52  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.03 
 
 
502 aa  52  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  21.6 
 
 
505 aa  50.8  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.15 
 
 
525 aa  50.8  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  25.97 
 
 
505 aa  50.4  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  25.97 
 
 
448 aa  50.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  26.62 
 
 
551 aa  49.3  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.38 
 
 
502 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.97 
 
 
500 aa  48.5  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  25.97 
 
 
552 aa  48.1  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.56 
 
 
501 aa  47.8  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.14 
 
 
499 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>