98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2548 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  58.88 
 
 		 510 aa  635    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  58.73 
 
 		 505 aa  639    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 503 aa  1044    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  60.12 
 
 		 502 aa  641    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  68.13 
 
 		 502 aa  734    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  62.8 
 
 		 501 aa  673    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  59.8 
 
 		 499 aa  630  1e-179  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  58.45 
 
 		 514 aa  626  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.98 
 
 		 502 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.98 
 
 		 502 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  53.59 
 
 		 507 aa  566  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.69 
 
 		 502 aa  567  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.49 
 
 		 504 aa  552  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  50.6 
 
 		 505 aa  544  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.89 
 
 		 504 aa  541  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.8 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.7 
 
 		 506 aa  536  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  48.71 
 
 		 506 aa  531  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  49.4 
 
 		 525 aa  525  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  49.5 
 
 		 507 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.91 
 
 		 501 aa  519  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.52 
 
 		 507 aa  517  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  49.31 
 
 		 501 aa  513  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.74 
 
 		 507 aa  513  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.13 
 
 		 503 aa  505  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.7 
 
 		 515 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.3 
 
 		 511 aa  502  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.11 
 
 		 500 aa  499  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  48.42 
 
 		 527 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  47.75 
 
 		 522 aa  493  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.83 
 
 		 508 aa  485  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  53.1 
 
 		 448 aa  485  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  46.06 
 
 		 515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  45.74 
 
 		 566 aa  462  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.01 
 
 		 512 aa  445  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.96 
 
 		 548 aa  439  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.35 
 
 		 501 aa  432  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.95 
 
 		 499 aa  427  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.64 
 
 		 484 aa  292  1e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.88 
 
 		 484 aa  291  2e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  36.04 
 
 		 504 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.2 
 
 		 511 aa  263  8e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  33.77 
 
 		 543 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.38 
 
 		 534 aa  219  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.04 
 
 		 493 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  31.22 
 
 		 501 aa  208  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.45 
 
 		 503 aa  196  8.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.58 
 
 		 549 aa  196  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.19 
 
 		 662 aa  173  7.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.05 
 
 		 521 aa  172  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.28 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.75 
 
 		 514 aa  170  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  29.1 
 
 		 534 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.33 
 
 		 510 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.37 
 
 		 505 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.56 
 
 		 535 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.76 
 
 		 513 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.09 
 
 		 526 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.15 
 
 		 529 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.19 
 
 		 512 aa  157  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.61 
 
 		 515 aa  152  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  26.01 
 
 		 551 aa  150  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  40 
 
 		 732 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.48 
 
 		 526 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  27 
 
 		 507 aa  147  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.92 
 
 		 551 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  25.97 
 
 		 552 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.55 
 
 		 509 aa  143  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.1 
 
 		 778 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  26.27 
 
 		 505 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.77 
 
 		 525 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.14 
 
 		 506 aa  137  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.88 
 
 		 703 aa  130  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  32.2 
 
 		 772 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.93 
 
 		 508 aa  122  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  25 
 
 		 691 aa  117  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.38 
 
 		 684 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.53 
 
 		 704 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.3 
 
 		 704 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1789  putative alpha-L-arabinofuranosidase  34.07 
 
 		 550 aa  76.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0379328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  21.89 
 
 		 679 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.26 
 
 		 644 aa  66.6  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.26 
 
 		 634 aa  66.6  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.64 
 
 		 826 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  24.38 
 
 		 821 aa  60.5  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.22 
 
 		 824 aa  59.7  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.95 
 
 		 663 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  24.12 
 
 		 660 aa  56.6  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.09 
 
 		 661 aa  55.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.15 
 
 		 818 aa  53.9  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6365  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.72 
 
 		 579 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  22.81 
 
 		 699 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  21.21 
 
 		 855 aa  50.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.39 
 
 		 483 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  22.87 
 
 		 959 aa  48.5  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1170  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  35.14 
 
 		 693 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000394833  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2071  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.91 
 
 		 535 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0895  alpha-L-arabinofuranosidase  24.54 
 
 		 732 aa  46.6  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>