100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07120 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  76.39 
 
 
504 aa  796    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  100 
 
 
525 aa  1075    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  75.45 
 
 
507 aa  785    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  67.46 
 
 
506 aa  699    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  78.69 
 
 
501 aa  812    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  66.01 
 
 
511 aa  687    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  64.76 
 
 
515 aa  678    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  62.13 
 
 
507 aa  608  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  60.52 
 
 
507 aa  609  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  57.77 
 
 
504 aa  575  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  58.04 
 
 
503 aa  576  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  56.36 
 
 
522 aa  570  1e-161  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  57.34 
 
 
515 aa  571  1e-161  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  60.61 
 
 
500 aa  566  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  55.4 
 
 
505 aa  555  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.75 
 
 
501 aa  550  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  62.5 
 
 
448 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  50 
 
 
502 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.35 
 
 
510 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.77 
 
 
512 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  51.3 
 
 
502 aa  529  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.4 
 
 
503 aa  530  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.99 
 
 
499 aa  528  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.36 
 
 
508 aa  526  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  54.03 
 
 
527 aa  522  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.79 
 
 
506 aa  525  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.9 
 
 
505 aa  514  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.77 
 
 
514 aa  510  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  49.09 
 
 
507 aa  504  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  48.35 
 
 
566 aa  496  1e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.99 
 
 
502 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.41 
 
 
502 aa  491  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.08 
 
 
502 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.64 
 
 
502 aa  482  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  41.92 
 
 
501 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.2 
 
 
548 aa  417  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  44 
 
 
499 aa  405  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.17 
 
 
501 aa  398  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.29 
 
 
484 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.09 
 
 
484 aa  301  2e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  39.11 
 
 
504 aa  286  8e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  34.58 
 
 
543 aa  251  3e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.25 
 
 
511 aa  244  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  31.11 
 
 
501 aa  220  6e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.92 
 
 
493 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.85 
 
 
492 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.61 
 
 
534 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.36 
 
 
549 aa  189  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.44 
 
 
521 aa  187  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.81 
 
 
514 aa  186  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.77 
 
 
526 aa  185  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.42 
 
 
503 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.01 
 
 
512 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.59 
 
 
513 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.51 
 
 
506 aa  176  7e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  27.88 
 
 
534 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.15 
 
 
662 aa  174  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.81 
 
 
510 aa  173  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.73 
 
 
526 aa  172  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  30.04 
 
 
551 aa  168  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.57 
 
 
515 aa  168  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.57 
 
 
535 aa  168  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.1 
 
 
505 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  29.21 
 
 
552 aa  166  9e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.38 
 
 
509 aa  164  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  27.41 
 
 
505 aa  164  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.02 
 
 
732 aa  163  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.96 
 
 
507 aa  161  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.68 
 
 
529 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.32 
 
 
691 aa  151  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.12 
 
 
778 aa  150  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.42 
 
 
703 aa  147  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.46 
 
 
772 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.42 
 
 
525 aa  144  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.43 
 
 
551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.25 
 
 
508 aa  140  7e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.96 
 
 
684 aa  113  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.91 
 
 
704 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.82 
 
 
704 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  27.07 
 
 
679 aa  89.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.53 
 
 
826 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1789  putative alpha-L-arabinofuranosidase  25.12 
 
 
550 aa  73.9  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0379328  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.6 
 
 
644 aa  73.9  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.6 
 
 
634 aa  73.9  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.28 
 
 
824 aa  71.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.99 
 
 
661 aa  70.5  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  26.57 
 
 
699 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.52 
 
 
663 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.83 
 
 
660 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.92 
 
 
855 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  26.88 
 
 
821 aa  62  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.9 
 
 
483 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  26.57 
 
 
959 aa  57.8  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1170  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  28.57 
 
 
693 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000394833  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2071  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.9 
 
 
535 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0895  alpha-L-arabinofuranosidase  25.87 
 
 
732 aa  52.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6365  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.02 
 
 
579 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15975  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2382  hypothetical protein  29.79 
 
 
1002 aa  47.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02541  alpha-arabinofuranosidase (Eurofung)  25.15 
 
 
565 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.17 
 
 
818 aa  43.9  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>