96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0755 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  100 
 
 		 507 aa  1031    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  65.74 
 
 		 501 aa  662    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  63.1 
 
 		 504 aa  637    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  63.04 
 
 		 507 aa  662    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  62.67 
 
 		 506 aa  646    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  62.13 
 
 		 525 aa  622  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  60.2 
 
 		 511 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  61.35 
 
 		 500 aa  605  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  58.68 
 
 		 504 aa  603  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  58.55 
 
 		 507 aa  597  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  58.37 
 
 		 515 aa  593  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  57.51 
 
 		 505 aa  587  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  56.5 
 
 		 522 aa  555  1e-157  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  58.58 
 
 		 508 aa  557  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.97 
 
 		 510 aa  556  1e-157  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.69 
 
 		 501 aa  554  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  55.38 
 
 		 515 aa  546  1e-154  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.26 
 
 		 503 aa  547  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.45 
 
 		 506 aa  544  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  56 
 
 		 527 aa  540  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  62.2 
 
 		 448 aa  539  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.5 
 
 		 503 aa  538  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  50.8 
 
 		 502 aa  538  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  50 
 
 		 514 aa  533  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  50.79 
 
 		 502 aa  525  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.69 
 
 		 512 aa  524  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.53 
 
 		 505 aa  522  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  48.8 
 
 		 507 aa  518  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  51.57 
 
 		 566 aa  514  1e-144  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.41 
 
 		 499 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.49 
 
 		 502 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.51 
 
 		 502 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.71 
 
 		 502 aa  474  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.73 
 
 		 502 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  40.71 
 
 		 501 aa  455  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.17 
 
 		 499 aa  443  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.76 
 
 		 501 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.08 
 
 		 548 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.89 
 
 		 484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.89 
 
 		 484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  34.3 
 
 		 504 aa  281  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.25 
 
 		 511 aa  258  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  32.87 
 
 		 543 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.2 
 
 		 534 aa  233  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.7 
 
 		 501 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.23 
 
 		 549 aa  209  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.31 
 
 		 493 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.54 
 
 		 526 aa  199  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.27 
 
 		 503 aa  192  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  32.2 
 
 		 551 aa  184  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.74 
 
 		 662 aa  184  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.35 
 
 		 492 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.76 
 
 		 512 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.87 
 
 		 505 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  24.28 
 
 		 513 aa  173  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.01 
 
 		 521 aa  173  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.51 
 
 		 514 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.94 
 
 		 526 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  26.36 
 
 		 534 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  29.75 
 
 		 552 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.65 
 
 		 507 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.97 
 
 		 732 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.34 
 
 		 535 aa  160  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.3 
 
 		 506 aa  159  8e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.21 
 
 		 510 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.94 
 
 		 778 aa  156  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.29 
 
 		 509 aa  155  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.22 
 
 		 525 aa  154  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.24 
 
 		 515 aa  153  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.74 
 
 		 551 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.15 
 
 		 703 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.26 
 
 		 529 aa  143  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.36 
 
 		 772 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  25.25 
 
 		 505 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.8 
 
 		 691 aa  133  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  23.32 
 
 		 508 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.95 
 
 		 704 aa  87  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.56 
 
 		 684 aa  84.7  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.1 
 
 		 663 aa  75.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  25 
 
 		 634 aa  73.9  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  25 
 
 		 644 aa  73.9  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  24.13 
 
 		 679 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.14 
 
 		 704 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.57 
 
 		 824 aa  67  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.92 
 
 		 855 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.75 
 
 		 826 aa  63.9  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1789  putative alpha-L-arabinofuranosidase  24.77 
 
 		 550 aa  58.9  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0379328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0895  alpha-L-arabinofuranosidase  26.26 
 
 		 732 aa  57  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.84 
 
 		 661 aa  57  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  25.62 
 
 		 821 aa  56.2  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.58 
 
 		 660 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.51 
 
 		 483 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.219739 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02541  alpha-arabinofuranosidase (Eurofung)  21.43 
 
 		 565 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1170  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  28.48 
 
 		 693 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000394833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  24.15 
 
 		 699 aa  50.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6365  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.19 
 
 		 579 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15975  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>